43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0812 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
404 aa  808    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  36.34 
 
 
731 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  34.49 
 
 
762 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 
732 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  34.76 
 
 
709 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  33.87 
 
 
605 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.97 
 
 
682 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  33.63 
 
 
663 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2363  hypothetical protein  32.47 
 
 
646 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1587  putative chaperonin  32.17 
 
 
648 aa  144  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2211  hypothetical protein  31.98 
 
 
648 aa  144  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  32.86 
 
 
739 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  32.86 
 
 
703 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0990  hypothetical protein  31.88 
 
 
648 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.169795 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3008  hypothetical protein  31.99 
 
 
646 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.351476 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01976  hypothetical protein  31.41 
 
 
646 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1162  hypothetical protein  31.41 
 
 
646 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1571  putative chaperonin  31.56 
 
 
635 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.794604  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01965  hypothetical protein  31.14 
 
 
631 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  31.56 
 
 
1204 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  28.62 
 
 
1121 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0484  serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 
400 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4761  hypothetical protein  28.93 
 
 
673 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479524  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0632  serine/threonine kinase-like protein  26.42 
 
 
498 aa  65.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1174  hypothetical protein  25.71 
 
 
505 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0503  putative protein kinase  26.69 
 
 
499 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0565  putative kinase protein  26.69 
 
 
499 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13600  hypothetical protein  25.66 
 
 
523 aa  55.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2211  hypothetical protein  25.32 
 
 
614 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.80254  normal  0.25915 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4257  protein kinase  26.47 
 
 
475 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0410  serine/threonine protein kinase  24.01 
 
 
439 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.663027 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2033  protein kinase  27.52 
 
 
472 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.960362  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3682  putative kinase protein  24.68 
 
 
499 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4664  serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 
499 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.109697 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.17 
 
 
584 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4195  serine/threonine protein kinase  25.33 
 
 
447 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0555562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0235  serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 
284 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3004  protein kinase  28.06 
 
 
202 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1722  cyclic nucleotide-binding protein  25.88 
 
 
454 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.107588  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf717  serine/threonine protein kinase  27.07 
 
 
332 aa  43.9  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
1009 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  27.27 
 
 
1017 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  27.27 
 
 
1009 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>