33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1447 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1447  PT repeat-containing protein  100 
 
 
618 aa  1173    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1577  hypothetical protein  39.09 
 
 
374 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.806322  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  36.89 
 
 
830 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  38.62 
 
 
1394 aa  94.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  36.23 
 
 
1000 aa  91.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  42.5 
 
 
916 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  26.86 
 
 
1584 aa  81.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0456  hypothetical protein  21.48 
 
 
2764 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000000873422 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  36.41 
 
 
504 aa  70.5  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0739  PKD domain containing protein  32.09 
 
 
877 aa  63.9  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.000357401  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0179  hypothetical protein  28.18 
 
 
544 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  24.2 
 
 
674 aa  62  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.65 
 
 
261 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  28.65 
 
 
648 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4273  spore coat assembly protein SafA  16.95 
 
 
721 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0735  hypothetical protein  30.83 
 
 
586 aa  53.9  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  32.6 
 
 
625 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  34.23 
 
 
840 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  29.62 
 
 
2313 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  30.73 
 
 
1096 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46569  predicted protein  27.41 
 
 
818 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61135  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47260  predicted protein  29.96 
 
 
398 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.776237  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  35.65 
 
 
136 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  47.29 
 
 
407 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  34.38 
 
 
467 aa  47.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  39.5 
 
 
590 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  38.81 
 
 
453 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  37.69 
 
 
433 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  33.33 
 
 
671 aa  45.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  31.68 
 
 
633 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4084  PT repeat-containing protein  66.04 
 
 
202 aa  44.3  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000901223  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  39.77 
 
 
735 aa  43.9  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3858  rhs element Vgr protein  38.96 
 
 
258 aa  43.9  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>