More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1051 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  100 
 
 		 236 aa  473  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  60.09 
 
 		 234 aa  271  7e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  54.04 
 
 		 235 aa  251  5.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  56.77 
 
 		 229 aa  245  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  54.27 
 
 		 234 aa  234  6e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  47.09 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  49.53 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  43.56 
 
 		 230 aa  176  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  42.98 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  44.6 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  41.78 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  40.69 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  40 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  40.62 
 
 		 225 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  44.44 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  40 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  40 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  40.26 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  38.46 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  38.89 
 
 		 227 aa  138  6e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  37.24 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  35.81 
 
 		 217 aa  114  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  38.46 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  32.22 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  41.92 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  28.82 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  35.93 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  38.62 
 
 		 217 aa  99.4  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  37.37 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  31.86 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  31.4 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  32.18 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  31.17 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  31.17 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  31 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  30 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  30 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  30 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  30 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  30 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  30 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  31.17 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  30 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  30 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  30.87 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  31.16 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  31.28 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  32.66 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  30.04 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  31.17 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  30.91 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  29.36 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  31.12 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  29.58 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  30.39 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  30 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  29.58 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  29.58 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  29.8 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  30 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  29.58 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  29.58 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2031  uridylate kinase  32.6 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1117  uridylate kinase  32.6 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  30.42 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  30 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  30.42 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_004310  BR1160  uridylate kinase  32.6 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  31.17 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  33.52 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  32.24 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  30 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  33.52 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3831  uridylate kinase  33.33 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1047  uridylate kinase  31.53 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.309878  normal  0.307589 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  30 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  31.12 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  32.84 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  32.23 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  30.73 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  29.34 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  30.83 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  29.83 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  30.83 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1133  uridylate kinase  33.97 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  28.69 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  33.33 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2524  uridylate kinase  32.16 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  32.18 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  31.19 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  30 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  29.57 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0527  uridylate kinase  29.41 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  30.27 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  28.64 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  28.22 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  30.88 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  30.73 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  29.68 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  27.98 
 
 		 245 aa  72  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>