More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4853 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 476 aa  942    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  94.33 
 
 		 503 aa  878    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  66.46 
 
 		 516 aa  627  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0951  amino acid permease-associated region  68.44 
 
 		 494 aa  591  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  48.28 
 
 		 506 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  47.48 
 
 		 497 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  43.12 
 
 		 517 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  45.88 
 
 		 510 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  42.01 
 
 		 553 aa  357  1.9999999999999998e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  42.89 
 
 		 516 aa  346  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  40.82 
 
 		 535 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  40.62 
 
 		 513 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  40.41 
 
 		 535 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  42.62 
 
 		 507 aa  339  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  41.55 
 
 		 517 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  43.06 
 
 		 524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0176  amino acid permease-associated region  39.79 
 
 		 512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  38.4 
 
 		 513 aa  315  9e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  40.13 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4678  amino acid permease-associated region  39.43 
 
 		 508 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  38.44 
 
 		 484 aa  276  8e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 456 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 485 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  26.8 
 
 		 458 aa  126  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  25.67 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 		 462 aa  97.1  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  25.12 
 
 		 456 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 		 455 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  28.06 
 
 		 443 aa  93.6  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  24.38 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 461 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 443 aa  91.3  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  25.33 
 
 		 461 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 461 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  25.33 
 
 		 461 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 		 450 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 443 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 443 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 443 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 455 aa  90.5  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 443 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 		 443 aa  90.1  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  25.33 
 
 		 461 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  25.12 
 
 		 461 aa  90.1  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  25.33 
 
 		 461 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  25.33 
 
 		 461 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  25.33 
 
 		 461 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  25.55 
 
 		 449 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 443 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 450 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 		 456 aa  87  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  26.02 
 
 		 443 aa  86.7  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 443 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  23.73 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  23.12 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  23.97 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.48 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  25.14 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  25.71 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  25.49 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  23.4 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  24.87 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  24.14 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.02 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 549 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  22.62 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 503 aa  79  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  25.72 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  25.72 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  21.78 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3082  amino acid permease  24.44 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  25.72 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.78 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  26.17 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  26.17 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  25.72 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  26.17 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2421  amino acid permease family protein  24.93 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  21.61 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.31 
 
 		 489 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  26.78 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.73 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  25.94 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.73 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.73 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.73 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2517  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0624875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.73 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.73 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.43 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  24.7 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>