More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3479 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3479  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
336 aa  667    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.784291  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1690  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  54.28 
 
 
339 aa  380  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3300  alcohol dehydrogenase  39.35 
 
 
337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3643  alcohol dehydrogenase  36.76 
 
 
347 aa  215  8e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.826426  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0217  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  31.56 
 
 
339 aa  156  4e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  32.15 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.36 
 
 
357 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.28 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  30.97 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.65 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000625  zinc-binding dehydrogenase  30.77 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0952  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.48 
 
 
359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000662515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.12 
 
 
346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  28.73 
 
 
375 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.92 
 
 
341 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0305  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0851572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 
354 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  28.21 
 
 
345 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.84 
 
 
354 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.32 
 
 
351 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 
365 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.56 
 
 
371 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  29.56 
 
 
371 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.56 
 
 
371 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0310  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.84 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.13 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  27.76 
 
 
340 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  28.33 
 
 
358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.01 
 
 
352 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3714  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  26.98 
 
 
348 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.15 
 
 
344 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.55 
 
 
345 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  30.53 
 
 
354 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.97 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.19 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3224  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.75 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.95 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  30.22 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3221  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.87 
 
 
358 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000142115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.61 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.22 
 
 
345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 
345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
364 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
351 aa  113  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  30.07 
 
 
353 aa  112  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.92 
 
 
373 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 
373 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
373 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
349 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7649  zinc-binding dehydrogenase  29.53 
 
 
357 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.298467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  27.2 
 
 
343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  28.41 
 
 
343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20290  xylitol dehydrogeanse  32.75 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92253  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  28.12 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.95 
 
 
347 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
337 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  29.45 
 
 
347 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  27.25 
 
 
345 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5213  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.61 
 
 
354 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000291101  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  29.45 
 
 
347 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.45 
 
 
347 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  29.45 
 
 
347 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.09 
 
 
342 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.33 
 
 
366 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  29.33 
 
 
366 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.74 
 
 
329 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0780  L-threonine 3-dehydrogenase  30.42 
 
 
348 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
351 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  28.06 
 
 
352 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0394  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  29.71 
 
 
345 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  28.41 
 
 
341 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  27.89 
 
 
346 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
357 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  29.15 
 
 
347 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  29.81 
 
 
355 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  30.06 
 
 
339 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  29.15 
 
 
347 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4040  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
356 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0364126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  27.54 
 
 
363 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.86 
 
 
350 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  31.28 
 
 
346 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
373 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.47 
 
 
373 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  29.15 
 
 
347 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
365 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16590  xylitol dehydrogenase, zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  30.25 
 
 
346 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.14 
 
 
342 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
350 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  27.83 
 
 
363 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.24 
 
 
349 aa  106  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  27.11 
 
 
341 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  27.11 
 
 
341 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>