More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0654 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0654  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  525  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0633475  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  99.63 
 
 
269 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  98.14 
 
 
266 aa  510  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  98.14 
 
 
266 aa  510  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  98.14 
 
 
266 aa  510  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  65.85 
 
 
255 aa  330  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  63.1 
 
 
257 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0361  hypothetical protein  64.92 
 
 
256 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3984  hypothetical protein  63.89 
 
 
257 aa  328  7e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  62.84 
 
 
271 aa  327  9e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  62.84 
 
 
271 aa  327  9e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  61.66 
 
 
255 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4401  hypothetical protein  62.45 
 
 
250 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  63.86 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0264  hypothetical protein  59.92 
 
 
256 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0273  hypothetical protein  59.92 
 
 
256 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0283  hypothetical protein  59.92 
 
 
256 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2506  hypothetical protein  59.59 
 
 
269 aa  298  8e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3686  hypothetical protein  57.75 
 
 
270 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3673  hypothetical protein  57.75 
 
 
270 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  59.84 
 
 
254 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3746  hypothetical protein  57.75 
 
 
270 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  59.11 
 
 
270 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2849  hypothetical protein  59.11 
 
 
270 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  59.43 
 
 
254 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  59.43 
 
 
254 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  61.54 
 
 
237 aa  293  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13535  integral membrane protein YrbE4a  58.37 
 
 
254 aa  294  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  58.13 
 
 
265 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  61.11 
 
 
237 aa  292  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3952  protein of unknown function DUF140  59.84 
 
 
254 aa  290  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10168  integral membrane protein YrbE1a  57.68 
 
 
265 aa  290  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  58.13 
 
 
265 aa  288  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4152  hypothetical protein  60.41 
 
 
269 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10598  integral membrane protein YrbE2a  56.96 
 
 
265 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0106  hypothetical protein  57.79 
 
 
265 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0116  hypothetical protein  57.79 
 
 
265 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0125  hypothetical protein  57.79 
 
 
265 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288689  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0920  hypothetical protein  63.41 
 
 
255 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.403471 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5634  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  93.89 
 
 
206 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639594  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  45.61 
 
 
285 aa  228  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  47.21 
 
 
250 aa  224  8e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  45.61 
 
 
260 aa  218  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  43.75 
 
 
253 aa  215  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  45.9 
 
 
261 aa  211  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2250  protein of unknown function DUF140  44.86 
 
 
267 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09380  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  46.08 
 
 
267 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  48.65 
 
 
268 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  43.75 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2826  hypothetical protein  41.42 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3830  protein of unknown function DUF140  38.82 
 
 
267 aa  178  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  41.15 
 
 
281 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0520  protein of unknown function DUF140  40.93 
 
 
262 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  39.91 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11995  integral membrane protein YrbE3a  59.7 
 
 
141 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3025  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  40.47 
 
 
269 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1246  protein of unknown function DUF140  39.91 
 
 
285 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.869523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4170  protein of unknown function DUF140  37.35 
 
 
285 aa  146  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11994  integral membrane protein YrbE3a  61.82 
 
 
132 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  38.02 
 
 
349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  36.48 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0708  protein of unknown function DUF140  36.48 
 
 
272 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356543  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  33.62 
 
 
263 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  34.43 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  27.31 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  36.41 
 
 
366 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  36.41 
 
 
366 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  31.14 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  36.22 
 
 
366 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  32.26 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  32.39 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  35.32 
 
 
269 aa  112  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0833  hypothetical protein  36.02 
 
 
297 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  32.77 
 
 
406 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  33.67 
 
 
258 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  36.55 
 
 
370 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  32.17 
 
 
376 aa  108  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  32.77 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  34.2 
 
 
257 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  32.02 
 
 
261 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  32.99 
 
 
365 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  31.86 
 
 
256 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  34.52 
 
 
364 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  30.6 
 
 
257 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  32.22 
 
 
385 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  33.48 
 
 
260 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  33.48 
 
 
260 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  31.16 
 
 
384 aa  105  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  34.95 
 
 
387 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  30.53 
 
 
256 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  32.57 
 
 
260 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  32.64 
 
 
258 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  31.47 
 
 
263 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  31.47 
 
 
263 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  30.43 
 
 
270 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  29.15 
 
 
252 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  33.19 
 
 
373 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  28.7 
 
 
258 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  29.79 
 
 
269 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  32.73 
 
 
264 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.125379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>