49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0194 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0194  GDSL family lipase  100 
 
 
253 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0711  hypothetical protein  84.81 
 
 
248 aa  394  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0548  hypothetical protein  66.8 
 
 
253 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.675038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0560  hypothetical protein  66.27 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0538  hypothetical protein  66.27 
 
 
249 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1805  hypothetical protein  45.76 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0114051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2886  hypothetical protein  44.05 
 
 
295 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1455  hypothetical protein  40.98 
 
 
304 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4280  hypothetical protein  40.46 
 
 
263 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03570  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  36.58 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0683  hypothetical protein  40.32 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0864  hypothetical protein  38.61 
 
 
333 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.159324  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4490  GDSL family lipase  36.73 
 
 
299 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14839  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3726  GDSL family lipase  33.33 
 
 
388 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1033  hypothetical protein  32.67 
 
 
298 aa  96.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468233  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5000  GDSL family lipase  31.25 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189373  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1119  lipolytic protein G-D-S-L family  36.44 
 
 
297 aa  89  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00446637  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4925  hypothetical protein  36.33 
 
 
295 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4289  hypothetical protein  35.38 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4505  hypothetical protein  32.21 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0494409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2842  lipolytic protein G-D-S-L family  32.16 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148431  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12270  hypothetical protein  32.95 
 
 
295 aa  78.6  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  0.510292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0116  hypothetical protein  32.21 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3218  secreted hydrolase  35.5 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.246696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5610  GDSL family lipase  32.2 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593946  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0166  hypothetical protein  32.29 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0117  GDSL family lipase  29.85 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  28.83 
 
 
446 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30530  hypothetical protein  28.81 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0195  hypothetical protein  27.78 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0610  hypothetical protein  33.33 
 
 
455 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457827  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2931  hypothetical protein  32.82 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.538874  normal  0.280581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0951  Triacylglycerol lipase  27.98 
 
 
270 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4974  Triacylglycerol lipase  28.33 
 
 
261 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.809775  normal  0.295048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4904  Triacylglycerol lipase  28.33 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4380  putative secreted hydrolase  27.56 
 
 
305 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784206  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3869  hypothetical protein  29.74 
 
 
337 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000820088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1542  Triacylglycerol lipase  27.62 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429303  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3390  hypothetical protein  31.01 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7234  lipolytic protein G-D-S-L family  39.18 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2154  Triacylglycerol lipase  38.58 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1522  hypothetical protein  30.82 
 
 
289 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0608193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5827  Triacylglycerol lipase  27.6 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4585  Triacylglycerol lipase  24.7 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4796  secreted hydrolase  28.57 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2499  lipolytic protein G-D-S-L family  36.27 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1584  hypothetical protein  33.68 
 
 
272 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  23.76 
 
 
524 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3058  hypothetical protein  29.89 
 
 
295 aa  42.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>