More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1137 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1137  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 165 aa  340  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0401  transcription elongation factor, putative  54.88 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2011  putative transcription elongation factor  47.27 
 
 		 164 aa  141  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0721  GreA/GreB family elongation factor  47.27 
 
 		 164 aa  141  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.44423  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4601  transcription elongation factor GreB  43.56 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270285  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2845  GreA/GreB family elongation factor  45.4 
 
 		 153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4508  GreA/GreB family elongation factor  43.56 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2366  GreA/GreB family elongation factor  47.62 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.805703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4333  GreA/GreB family elongation factor  45.73 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  0.881109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4263  transcription elongation factor GreA/GreB  42.33 
 
 		 165 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4873  GreA/GreB family elongation factor  42.07 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.772503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2930  transcription elongation factor regulatory protein  46.26 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01570  transcription elongation factor, putative  41.07 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.808731  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5114  transcription elongation factor regulatory protein  44.85 
 
 		 161 aa  117  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3833  GreA/GreB family elongation factor  46.36 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0708  GreA/GreB family elongation factor  40.85 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2146  transcription elongation factor regulatory protein  43.64 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1741  transcription elongation factor regulatory protein  41.82 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3876  transcription elongation factor GreA/GreB domain-containing protein  42.68 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131848  normal  0.0366089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4186  GreA/GreB family elongation factor  42.68 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0673  transcription elongation factor GreB  37.1 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0253655  normal  0.983843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0676  GreA/GreB family elongation factor  40.96 
 
 		 165 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0865  transcription elongation factor GreB  36.67 
 
 		 186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.494541  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0707  GreA/GreB family elongation factor  39.88 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.975764  normal  0.0706669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0950  transcription elongation factor GreB  36.67 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380314  hitchhiker  0.0000173092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0909  transcription elongation factor GreB  37.63 
 
 		 189 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2390  transcription elongation factor regulatory protein  42.07 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0124543  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5139  transcription elongation factor regulatory protein  41.32 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.276669  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1580  transcription elongation factor regulatory protein  42.68 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0460715 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0520  transcription elongation factor GreB  38.04 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.525146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3202  transcription elongation factor regulatory protein  42.42 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3081  transcription elongation factor GreB  36.02 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0292072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1165  transcription elongation factor regulatory protein  41.22 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1591  transcription elongation factor GreB  36.76 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000320355  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2470  transcription elongation factor GreB  36.02 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0253654  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2707  GreA/GreB family elongation factor  40 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0395  transcription elongation factor GreB  39.1 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0662581  normal  0.0531871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2023  transcription elongation factor GreB  36.41 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4332  transcription elongation factor GreB  36.36 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.313941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0859  transcription elongation factor GreB  37.43 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1370  transcription elongation factor GreB  37.7 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2273  transcription elongation factor GreB  35.52 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2091  transcription elongation factor GreB  35.91 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1959  transcription elongation factor GreB  35.91 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51931  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1126  transcription elongation factor GreB  34.25 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.19101e-20  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3044  transcription elongation factor GreB  35.91 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00484653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0820  transcription elongation factor GreB  35.91 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2944  transcription elongation factor GreB  35.91 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143322  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3010  transcription elongation factor GreB  35.91 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.998685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2653  transcription elongation factor GreB  35.91 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0303907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0558  transcription elongation factor GreA domain-containing protein  40.85 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0874  transcription elongation factor GreB  37.91 
 
 		 187 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0745968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0862  transcription elongation factor GreB  37.91 
 
 		 187 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000987565  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0962  transcription elongation factor GreB  39.01 
 
 		 187 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00012209  normal  0.571045 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0523  transcription elongation factor GreB  39.01 
 
 		 187 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000760648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1002  transcription elongation factor GreB  39.01 
 
 		 187 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0052225  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0323  transcription elongation factor GreB  38.75 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.276985 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1871  transcription elongation factor GreB  36.56 
 
 		 213 aa  100  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  38.16 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2668  transcription elongation factor GreB  35.29 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.049462  normal  0.0488826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4357  transcription elongation factor regulatory protein  38.55 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0556  transcription elongation factor GreA domain-containing protein  40.24 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1950  transcription elongation factor GreB  35.52 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697488  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2396  transcription elongation factor GreB  36.76 
 
 		 187 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4110  transcription elongation factor GreB  37.91 
 
 		 187 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000102094  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0165  transcription elongation factor GreB  35.71 
 
 		 181 aa  98.2  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1201  transcription elongation factor GreB  35.67 
 
 		 161 aa  97.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0727535  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2152  transcription elongation factor GreB  35.33 
 
 		 187 aa  97.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000119957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2723  transcription elongation factor  36.26 
 
 		 213 aa  98.2  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2863  transcription elongation factor GreB  33.76 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1733  transcription elongation factor GreB  37.91 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0896689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2677  GreA/GreB family elongation factor  32.68 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1441  GreA/GreB family elongation factor  34.68 
 
 		 182 aa  95.5  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3586  transcription elongation factor GreB  35.87 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687664  hitchhiker  0.00676969 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0718  GreA/GreB family elongation factor  38 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.188728  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1753  GreA/GreB family elongation factor  33.96 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.322411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0731  GreA/GreB family elongation factor  38 
 
 		 158 aa  92.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000249638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1105  GreA/GreB family elongation factor  35.63 
 
 		 171 aa  92  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.340307  normal  0.981817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1332  GreA/GreB family elongation factor  33.7 
 
 		 190 aa  91.3  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.294175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1778  transcription elongation factor GreB  34.84 
 
 		 170 aa  90.9  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0732  transcription elongation factor GreB  33.69 
 
 		 189 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2119  GreA/GreB family elongation factor  36.36 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.702763  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1494  transcription elongation factor GreB  36.13 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3150  GreA/GreB family elongation factor  33.99 
 
 		 187 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1838  GreA/GreB family elongation factor  35.76 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  32.89 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1075  transcription elongation factor GreB  35.4 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4579  GreA/GreB family elongation factor  33.33 
 
 		 212 aa  88.6  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.063222  normal  0.427466 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0796  transcription elongation factor GreB  44.25 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0808  transcription elongation factor GreB  34.64 
 
 		 183 aa  87.8  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  32 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  37.09 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1206  GreA/GreB family elongation factor  40.62 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6110  transcription elongation factor GreB  36.36 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3981  transcription elongation factor GreB  34.87 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0768  transcription elongation factor GreA  39.81 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0171  transcription elongation factor GreB  34.87 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  30.67 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0307  transcription elongation factor GreB  34.67 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>