189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4367 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  83.62 
 
 		 430 aa  653    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  96.43 
 
 		 420 aa  773    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  100 
 
 		 463 aa  924    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  80.34 
 
 		 429 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  79.76 
 
 		 424 aa  617  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  56.81 
 
 		 412 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  48.59 
 
 		 409 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  41.88 
 
 		 422 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  41.63 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  43.07 
 
 		 415 aa  247  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  40.66 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  41.69 
 
 		 456 aa  243  5e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  41.62 
 
 		 414 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  42.01 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  41.52 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  40.53 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  41.41 
 
 		 413 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  39.47 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  38.38 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  36.12 
 
 		 419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  28.15 
 
 		 495 aa  139  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  34.24 
 
 		 476 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  28.31 
 
 		 495 aa  136  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  33.92 
 
 		 485 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  29.5 
 
 		 463 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  33.42 
 
 		 474 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  30.48 
 
 		 435 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  30.71 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  31.5 
 
 		 480 aa  117  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  32.96 
 
 		 458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  35.5 
 
 		 417 aa  113  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  32.28 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  33.76 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  29.17 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  29.78 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  29.66 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  35.32 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  29.06 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  31.08 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  26.05 
 
 		 436 aa  103  9e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  28.54 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  27.89 
 
 		 450 aa  97.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  30.1 
 
 		 434 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  31.62 
 
 		 504 aa  96.7  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  31.74 
 
 		 476 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  27.31 
 
 		 466 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  27.29 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  26.06 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  26.86 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  27.02 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  29.78 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  30.07 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  25.06 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  24.77 
 
 		 484 aa  75.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  40 
 
 		 492 aa  73.6  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  31.22 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  26.61 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  29.54 
 
 		 451 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  52.73 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  30.5 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  30.12 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  24.24 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  49.18 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  38.67 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  31.23 
 
 		 1199 aa  61.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  28.05 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  22.81 
 
 		 536 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  52.54 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  36.67 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  33.93 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  42.19 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  38.89 
 
 		 537 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  25.56 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  42.62 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  25.49 
 
 		 498 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  25.49 
 
 		 498 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  38.24 
 
 		 451 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  29.84 
 
 		 407 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  33.33 
 
 		 435 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  45.45 
 
 		 463 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  26.14 
 
 		 494 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  45.9 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  44.64 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  45.9 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  47.46 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  45.9 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  44.26 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  47.46 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  37.66 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  37.66 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  51.72 
 
 		 543 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  42.62 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  42.62 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  39.73 
 
 		 480 aa  50.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  26.92 
 
 		 1274 aa  50.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  45.76 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  41.82 
 
 		 447 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  41.38 
 
 		 367 aa  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  37.14 
 
 		 657 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2889  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  34.72 
 
 		 496 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.693571  normal  0.756055 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>