More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0854 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 120 aa  237  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  97.5 
 
 		 120 aa  229  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  93.33 
 
 		 120 aa  222  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  81.67 
 
 		 120 aa  201  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  75.83 
 
 		 120 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  66.96 
 
 		 120 aa  163  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  66.96 
 
 		 120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  66.96 
 
 		 120 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  66.09 
 
 		 120 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  64.91 
 
 		 121 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  66.67 
 
 		 121 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  59.83 
 
 		 119 aa  154  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  64.91 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  64.04 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  63.16 
 
 		 121 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  63.48 
 
 		 121 aa  153  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  57.98 
 
 		 123 aa  153  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  59.32 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  64.91 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  59.66 
 
 		 125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 		 122 aa  149  8.999999999999999e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  64.04 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  61.4 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  61.21 
 
 		 123 aa  143  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  57.5 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  57.89 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  57.89 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 		 123 aa  141  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  54.24 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4267  glycine cleavage system H protein  58.47 
 
 		 120 aa  141  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231851  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  60 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  58.12 
 
 		 121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  57.98 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  53.39 
 
 		 123 aa  137  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3146  glycine cleavage system H protein  54.17 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1937  glycine cleavage system H protein  55 
 
 		 124 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1740  glycine cleavage system H protein  55 
 
 		 124 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  58.62 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  58.82 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4327  glycine cleavage system H protein  52.5 
 
 		 124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  49.58 
 
 		 125 aa  134  6.0000000000000005e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4374  glycine cleavage system protein H  64.29 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.44648  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3621  glycine cleavage system protein H  54.39 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.666557  normal  0.082734 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  57.26 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  59.32 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  47.9 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2681  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.341923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 124 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  47.9 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  56.52 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  56.52 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  52.59 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2194  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0869  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.731856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  50.42 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  48.28 
 
 		 131 aa  126  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  52.1 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  54.7 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  44.44 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  50.85 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2298  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  51.28 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  50.85 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  49.58 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2347  glycine cleavage system H protein  52.54 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  56.44 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 131 aa  123  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3958  glycine cleavage system H protein  50.83 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0639572 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2189  glycine cleavage system protein H  51.3 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2836  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  49.15 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  53.51 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  56.36 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  50.86 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  44.83 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  50.45 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>