More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4515 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
275 aa  544  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
277 aa  226  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
282 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
279 aa  215  5e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.86 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.66 
 
 
283 aa  209  5e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
278 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
278 aa  204  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.08 
 
 
283 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 
292 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
283 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
275 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.433095 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.81 
 
 
307 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.642563  decreased coverage  0.0000998416 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
277 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
293 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3556  putative ABC transporter permease protein  38.81 
 
 
302 aa  195  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
293 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
277 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
306 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
281 aa  194  9e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  40.45 
 
 
275 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
253 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 
295 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
281 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
280 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
277 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
312 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
275 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
308 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.809225  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 
255 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1810  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.55 
 
 
280 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.817708  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
285 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
277 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
275 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
277 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.275556  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
282 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313327  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
292 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
277 aa  188  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
274 aa  188  9e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
281 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
275 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
291 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
287 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
296 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
292 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
289 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
286 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
277 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
306 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
279 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
280 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
279 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.468941  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
289 aa  185  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.98 
 
 
283 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.06 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1957  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.17 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.605299  normal  0.820662 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01289  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.17 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.240108  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01300  hypothetical protein  38.17 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.250115 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1427  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.17 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1522  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.17 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
299 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0255144 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
278 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
299 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.494114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
273 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
316 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313337  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25430  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.92 
 
 
275 aa  179  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0542318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
288 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
288 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  37.7 
 
 
275 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
276 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 
297 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
279 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
281 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
404 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.1795  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
311 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.578248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
276 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.68 
 
 
283 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
294 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
279 aa  175  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
278 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>