97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3961 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3961  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  805    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3149  hypothetical protein  52.09 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.717167  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2399  hypothetical protein  40.46 
 
 		 365 aa  255  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0143  hypothetical protein  24.51 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.184746  normal  0.13553 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1530  hypothetical protein  30.36 
 
 		 431 aa  117  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1356  acyltransferase family protein  28.06 
 
 		 380 aa  94.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0193  hypothetical protein  30 
 
 		 380 aa  90.5  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1952  acyltransferase family protein  33.19 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1967  hypothetical protein  28.43 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1316  hypothetical protein  26.14 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.893937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1581  hypothetical protein  26.14 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0181991 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0354  hypothetical protein  32.38 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1714  hypothetical protein  25.9 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3339  putative OpgC protein  27.8 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.523015 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3201  hypothetical protein  24.27 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4912  putative OpgC protein  27.85 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3260  hypothetical protein  26.12 
 
 		 374 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5254  hypothetical protein  25.36 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15377  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0112  hypothetical protein  26.17 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7260  putative opgC protein  25.72 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1292  hypothetical protein  28.77 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.721531  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0222  acyltransferase 3  28.05 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4163  putative OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  23.88 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1372  hypothetical protein  28.77 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0265  hypothetical protein  28.77 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1032  hypothetical protein  28.77 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.608592  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0535  hypothetical protein  28.77 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.306001  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1288  putative opgC protein  28.77 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2545  hypothetical protein  28.77 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4266  OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  23.18 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0899  putative OpgC protein  24.34 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1765  OpgC protein  28 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.411843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4870  hypothetical protein  25.24 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5546  hypothetical protein  25.17 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.753322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2784  putative OpgC protein  26.5 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537319  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5314  hypothetical protein  25.17 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0258075  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0765  hypothetical protein  26.91 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191126  hitchhiker  0.00877498 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3730  hypothetical protein  26.45 
 
 		 681 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1455  opgC protein, putative  27.06 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0128  OpgC protein  27.52 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253754  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4726  hypothetical protein  25.17 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3041  OpgC protein  28.7 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1295  OpgC protein-like protein  23.1 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333454  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3279  hypothetical protein  24.03 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2302  putative OpgC protein  25.28 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2532  putative OpgC protein  27 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2806  hypothetical protein  28.29 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0788  putative OpgC protein  24.07 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.107967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4043  hypothetical protein  26.03 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0814624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2190  OpgC protein  26.5 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.013941  normal  0.776218 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5417  hypothetical protein  25 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3644  hypothetical protein  26.74 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1137  hypothetical protein  22.86 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2936  putative OpgC protein  26.36 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2228  OpgC protein  28.94 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.297426 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0136  acyltransferase 3  24.07 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1064  putative membrane protein of unknown function  24.78 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2146  putative OpgC protein  25 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1533  hypothetical protein  21.74 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0145  hypothetical protein  25.7 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4886  hypothetical protein  21.74 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00335271  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1233  hypothetical protein  25 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1997  hypothetical protein  23.45 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3154  hypothetical protein  24.35 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1763  hypothetical protein  26.32 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2375  OpgC protein  23.87 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0332803  decreased coverage  0.00013342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4947  hypothetical protein  25.45 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.0617497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4172  putative protein required for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  26.04 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0389  hypothetical protein  23.9 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187966  normal  0.347328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1700  hypothetical protein  23.83 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646049  normal  0.417956 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1277  hypothetical protein  24.34 
 
 		 450 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4038  hypothetical protein  24.25 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0930  OpgC protein  25 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.918852  normal  0.510158 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1258  putative OpgC protein  24.34 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4496  hypothetical protein  25.46 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953.1  putative OpgC protein  24.34 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.584831  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0971  putative OpgC protein  24.34 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.346061  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3043  hypothetical protein  24.34 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2919  hypothetical protein  24.34 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2232  putative OpgC protein  24.34 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4415  hypothetical protein  28.72 
 
 		 459 aa  49.7  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247797  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6048  hypothetical protein  24.15 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.983197  normal  0.374141 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5696  hypothetical protein  25 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138728 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3642  hypothetical protein  34.94 
 
 		 826 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2280  hypothetical protein  26.7 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0956808  normal  0.124268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0127  hypothetical protein  24.36 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4608  hypothetical protein  25 
 
 		 365 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3760  hypothetical protein  25 
 
 		 365 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.500718  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2238  OpgC protein, putative  23.98 
 
 		 366 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0989  OpgC protein  23.75 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal  0.503682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0952  OpgC protein  23.75 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.242589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5813  hypothetical protein  24.17 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161405 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4038  hypothetical protein  24.54 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.372209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3844  putative protein required for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  28.81 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5561  OpgC protein  22.73 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0075  hypothetical protein  25.81 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0154  hypothetical protein  25.32 
 
 		 368 aa  43.1  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>