More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2784 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 
337 aa  685    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3886  alcohol dehydrogenase  66.14 
 
 
330 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025285  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5578  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.77 
 
 
328 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2432  alcohol dehydrogenase  63.41 
 
 
376 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2173  alcohol dehydrogenase  63.17 
 
 
315 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299508  decreased coverage  0.00992206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0521  putative Zn-containing dehydrogenase  62.15 
 
 
332 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.53 
 
 
323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.24 
 
 
319 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.92 
 
 
319 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00941244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.92 
 
 
319 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0715122  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3218  alcohol dehydrogenase  47.56 
 
 
332 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5595  zinc-binding oxidoreductase  45.62 
 
 
347 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0832  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.98 
 
 
316 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  31.66 
 
 
318 aa  147  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.36 
 
 
200 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.79 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  24.86 
 
 
358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.91 
 
 
344 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.77 
 
 
348 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  26.98 
 
 
345 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.36 
 
 
346 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  29.08 
 
 
339 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.35 
 
 
354 aa  95.9  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  28.11 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.45 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.3 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  28.11 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  28.11 
 
 
363 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.82 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  28.37 
 
 
365 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.4 
 
 
354 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  28.9 
 
 
319 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.6 
 
 
320 aa  93.2  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.4 
 
 
354 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.94 
 
 
336 aa  92.8  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  27.51 
 
 
363 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.24 
 
 
336 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  28.11 
 
 
354 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  25.5 
 
 
348 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.07 
 
 
342 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  26.04 
 
 
362 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  23.56 
 
 
352 aa  91.3  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.25 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 
324 aa  89.7  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  26.04 
 
 
362 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  31.25 
 
 
342 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  26.63 
 
 
360 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  29.74 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.88 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.51 
 
 
366 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.43 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.06 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.91 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  26.04 
 
 
362 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
337 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
344 aa  87.8  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.02 
 
 
373 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25570  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  28.99 
 
 
381 aa  87  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  25.95 
 
 
375 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
344 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  23.66 
 
 
374 aa  86.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.61 
 
 
327 aa  86.7  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
373 aa  86.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  27.35 
 
 
373 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
344 aa  85.9  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.38 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  28.67 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.73 
 
 
345 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.66 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.35 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.24 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  27.35 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  27.54 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  28.87 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0286  alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425659  normal  0.323725 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.22 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4227  alcohol dehydrogenase  27.94 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.463097  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.24 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.82 
 
 
341 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412094  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  34.4 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  23.84 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  25.7 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.03 
 
 
338 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.94 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  28.16 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.03 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0459  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.73 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.479531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.73 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  28.84 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>