95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0033 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.374525 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0023  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 92 bp  71.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0050  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0045  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0050  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0015  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0008  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0016  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0017  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0026  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0014  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0008  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0023  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0037  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27960  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.251504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11580  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00471501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0004  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000551383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0032  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891342 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0012  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0470905  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0024  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0005  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0047  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.327618  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1302  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0048  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0101109  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1359  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.89612  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0044  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0213479 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0019  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.698383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0035  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.802654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0049  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0003  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000169546  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0039  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0742703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0041  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.589584  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0017  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0052  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.258568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0007  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.715121  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0061  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0952351  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0060  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100748  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0022  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000743808  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0029  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0044  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000135641  normal  0.305478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0006  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0024  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.595817 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0019  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282273 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0004  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0658061 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0042  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0026  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0007  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t21  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0012  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000035701  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0039  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.801401  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  88.37 
 
 		 126 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0012  tRNA-OTHER  100 
 
 		 114 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0032  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000491895  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0061  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.318482  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0004  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.59905e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.44549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0062  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110057  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt03  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0034  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000648564  hitchhiker  0.0000599111 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_513  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0031  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218034  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07010  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1169  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000109978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0101  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0058  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0011  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0060178  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0526  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0043  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0032  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241794  hitchhiker  0.000000080319 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0033  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323834  hitchhiker  0.00000000664377 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0028  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208638  hitchhiker  0.00938841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0027  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0044  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.919429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0024  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000583743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0001  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0045  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000150485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0007  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000441599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0002  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000138039  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0012  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0039  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000237052  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0033  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0031  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 99 bp  44.1  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0026  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000484492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0001  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>