72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_R0003 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_R0003  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  184  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000169546  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07713  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0025  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4314  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.650713  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0034  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309260  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6042  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309375  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.748623  hitchhiker  0.000994808 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0019  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.698383 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0017  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576804  normal  0.691356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0025  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217878  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0031  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 99 bp  50.1  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0033  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.374525 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0014  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0017  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00284743  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0037  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.489158 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0051  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.267767  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0633  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248026  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t07  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506644  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0051  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573916  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000515355  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.710813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.600875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0015  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0008  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0014  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0016  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0675311 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4560  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0913747  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0017  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0025  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112044  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0060178  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.172474  normal  0.681526 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0051  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0017  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0024  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0448  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.359663  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0035  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.802654  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0039  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0742703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0001  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0030  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191497  normal  0.473607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0047  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0016  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0039  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0052  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.258568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0032  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891342 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0001  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0021  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0021  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0717904 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0005  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.087026  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0052  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0041  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.589584  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0044  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0213479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0034  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.626616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0024  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0049  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0048  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0101109  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0047  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.327618  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6023  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0046  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557666 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309091  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309106  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309205  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.98258  normal  0.324955 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0035  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>