12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_t0031 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_t0031  tRNA-Ser  100 
 
 		 99 bp  196  7e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0003  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000169546  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0015  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0008  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0014  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0016  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0012  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0008  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0017  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_R0095  tRNA-Phe  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.346221  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07010  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0033  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.374525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>