19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07010 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_07010  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0004  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0014  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0013  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03630  tRNA-Ser  82.14 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0004  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0039  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0742703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0033  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.374525 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0004  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.558819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0032  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891342 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0017  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0031  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 99 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0016  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0014  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0015  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>