11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_R0014 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0013  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  180  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03630  tRNA-Ser  90.28 
 
 
88 bp  87.7  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187343  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0004  tRNA-Ser  87.88 
 
 
88 bp  67.9  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.558819  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07010  tRNA-Ser  91.11 
 
 
88 bp  58  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0030  tRNA-Ser  89.13 
 
 
92 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.305018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0007  tRNA-Ser  84.06 
 
 
91 bp  50.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000138039  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0004  tRNA-Ser  93.33 
 
 
85 bp  44.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0773482 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26020  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>