39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0004 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0658061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0045  tRNA-Ser  97.73 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27960  tRNA-Ser  95.24 
 
 		 93 bp  67.9  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.251504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11580  tRNA-Ser  95.24 
 
 		 93 bp  67.9  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00471501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0004  tRNA-Ser  95.24 
 
 		 91 bp  67.9  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000551383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0062  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0048  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 88 bp  60  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0006  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0007  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0003  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 88 bp  60  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0054  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  92.5 
 
 		 126 bp  56  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0056  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0005  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t21  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0044  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000135641  normal  0.305478 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4308  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0005  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer01  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454319  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0065  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0095  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0001  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6020  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0077  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0058  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0044  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564577 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0033  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.374525 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0064  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.59858e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0050  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0042  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.835093  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0023  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0087  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000189881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0065  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0064  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lplt15  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt15  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>