76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3287 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3287  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 
276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1619  N-formylglutamate amidohydrolase  44.03 
 
 
262 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.158833 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0639  N-formylglutamate amidohydrolase  28.08 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1317  N-formylglutamate amidohydrolase  27.24 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.256514  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1003  N-formylglutamate amidohydrolase  23.55 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  27.24 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2959  N-formylglutamate amidohydrolase  29.46 
 
 
274 aa  62  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  29.49 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  28 
 
 
267 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67240  N-formylglutamate amidohydrolase  27.62 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.982429  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  27.75 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  26.64 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  27.73 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  26.52 
 
 
266 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  26.48 
 
 
266 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  27.75 
 
 
271 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  26.64 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  30.19 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  25.45 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  26.88 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2038  N-formylglutamate amidohydrolase  24.8 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  28.93 
 
 
285 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1674  N-formylglutamate amidohydrolase  28.93 
 
 
267 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2925  N-formylglutamate amidohydrolase  28.93 
 
 
267 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2660  N-formylglutamate amidohydrolase  28.93 
 
 
267 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0652  N-formylglutamate amidohydrolase  28.93 
 
 
267 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  24.82 
 
 
267 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  27.75 
 
 
266 aa  52.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1666  N-formylglutamate amidohydrolase  24.8 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228926  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  27.85 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  30.19 
 
 
265 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  28.03 
 
 
263 aa  52.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  30.38 
 
 
265 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  28.93 
 
 
267 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  26.14 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  28.93 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  29.03 
 
 
344 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  28.49 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00728  N-formylglutamate amidohydrolase  26.32 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  28.76 
 
 
277 aa  50.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  24.26 
 
 
295 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5824  N-formylglutamate amidohydrolase  26.26 
 
 
266 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  28.32 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  28.1 
 
 
270 aa  49.7  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  30.19 
 
 
267 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  27.37 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  26.58 
 
 
271 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1826  N-formylglutamate amidohydrolase  27.85 
 
 
288 aa  48.9  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  28.03 
 
 
271 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  28.66 
 
 
271 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  27.15 
 
 
258 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  28.21 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  26.17 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  23.92 
 
 
271 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5911  N-formylglutamate amidohydrolase  28.93 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.355431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2166  N-formylglutamate amidohydrolase  28.93 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  25.58 
 
 
293 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2711  N-formylglutamate deformylase  27.2 
 
 
270 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  23.51 
 
 
281 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  24.18 
 
 
281 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4155  N-formylglutamate amidohydrolase  26.69 
 
 
266 aa  46.2  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  25.12 
 
 
310 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  25.78 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  26.58 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  28.3 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4642  N-formylglutamate amidohydrolase  27.54 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  24.59 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2076  N-formylglutamate amidohydrolase  29.9 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  23.23 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26150  N-formylglutamate amidohydrolase  31.91 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0887292  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  22.08 
 
 
293 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  28.38 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  27.68 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  27.23 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1188  N-formylglutamate amidohydrolase  34.41 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.550725  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  28.39 
 
 
287 aa  42.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>