97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2680 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2680  Tryptophan 2,3-dioxygenase apoenzyme  100 
 
 
276 aa  570  1.0000000000000001e-162  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0730957  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2119  tryptophan 2,3-dioxygenase  77.54 
 
 
275 aa  451  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.352287 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2857  tryptophan 2,3-dioxygenase  62.32 
 
 
323 aa  362  4e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202528  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2440  tryptophan 2,3-dioxygenase  57.72 
 
 
289 aa  329  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0807  tryptophan 2,3-dioxygenase  55.43 
 
 
294 aa  324  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2764  tryptophan 2,3-dioxygenase  53.43 
 
 
279 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2651  tryptophan 2,3-dioxygenase  54.68 
 
 
299 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1447  tryptophan 2,3-dioxygenase  54.55 
 
 
282 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2806  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.71 
 
 
279 aa  316  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.486635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2486  tryptophan 2,3-dioxygenase  53.07 
 
 
279 aa  316  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2161  tryptophan 2,3-dioxygenase  54.15 
 
 
291 aa  315  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282378  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2759  tryptophan 2,3-dioxygenase  53.07 
 
 
279 aa  315  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000548978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2528  tryptophan 2,3-dioxygenase  53.07 
 
 
279 aa  315  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108456 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2521  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.71 
 
 
279 aa  315  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0237432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0758  putative oxygenase oxidoreductase protein  52.96 
 
 
294 aa  315  6e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.221118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2785  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  52.71 
 
 
279 aa  315  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00473173  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2557  tryptophan 23-dioxygenase  52.35 
 
 
279 aa  315  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.216289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2565  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  52.71 
 
 
279 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00198085  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2751  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  52.71 
 
 
279 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3020  tryptophan 2,3-dioxygenase  54.65 
 
 
282 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1155  tryptophan 2,3-dioxygenase  54.65 
 
 
301 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404578  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0774  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.96 
 
 
291 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.200529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0708  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.96 
 
 
278 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3590  tryptophan 2,3-dioxygenase  55.02 
 
 
294 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1901  tryptophan 23-dioxygenase  52.35 
 
 
279 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0805184  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0506  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.59 
 
 
311 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  hitchhiker  0.0076457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6511  tryptophan 2,3-dioxygenase  56.55 
 
 
279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153558  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2170  tryptophan 2,3-dioxygenase  53.9 
 
 
286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0663818  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3229  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.59 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0709  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  52.22 
 
 
316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0733  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.22 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309668  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2498  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.38 
 
 
313 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2579  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.59 
 
 
311 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2603  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.59 
 
 
316 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1968  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.59 
 
 
311 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148604  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2627  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.38 
 
 
313 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0892  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.22 
 
 
311 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0895  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.22 
 
 
353 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1053  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  52.22 
 
 
311 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5910  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.59 
 
 
310 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0351  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  51.85 
 
 
315 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2485  tryptophan 2,3-dioxygenase  51.85 
 
 
306 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0098  tryptophan 2,3-dioxygenase  51.85 
 
 
306 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0231153  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0650  tryptophan 2,3-dioxygenase  51.85 
 
 
306 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00581911  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0718  tryptophan 2,3-dioxygenase  51.09 
 
 
320 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.426703  normal  0.516699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2637  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.75 
 
 
288 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2084  tryptophan 2,3-dioxygenase  53.73 
 
 
307 aa  296  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.217296  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30750  putative tryptophan oxygenase  52.38 
 
 
288 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000713214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1403  tryptophan 23-dioxygenase  50 
 
 
286 aa  292  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1469  tryptophan 2,3-dioxygenase  53.53 
 
 
282 aa  291  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0400498  normal  0.0512529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0590  tryptophan 2,3-dioxygenase  52.69 
 
 
285 aa  287  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3022  tryptophan 23-dioxygenase  49.44 
 
 
280 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2226  tryptophan 2,3-dioxygenase  51.31 
 
 
279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483292  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1864  tryptophan 23-dioxygenase  48.69 
 
 
286 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112254  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1436  tryptophan 2,3-dioxygenase  47.37 
 
 
284 aa  262  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000454003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1431  tryptophan 2,3-dioxygenase  46.24 
 
 
284 aa  258  9e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165592  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02210  Tryptophan 2,3-dioxygenase  48.51 
 
 
282 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.216655  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1391  tryptophan 2,3-dioxygenase  47.13 
 
 
301 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000659483  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3745  tryptophan 23-dioxygenase  46.27 
 
 
291 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04220  tryptophan 2,3-dioxygenase  45.15 
 
 
297 aa  238  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2295  tryptophan 23-dioxygenase  47.55 
 
 
310 aa  234  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.531759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2024  tryptophan 23-dioxygenase  44.88 
 
 
299 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5244  tryptophan 23-dioxygenase  40.86 
 
 
311 aa  212  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.637424 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0921  tryptophan 2,3-dioxygenase  42.97 
 
 
286 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00417664  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3906  tryptophan 23-dioxygenase  39.93 
 
 
298 aa  204  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0143  tryptophan 23-dioxygenase  38.72 
 
 
298 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.55165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0786  Tryptophan 2,3-dioxygenase apoenzyme  43.73 
 
 
295 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.841363  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3531  tryptophan 2,3-dioxygenase  39.55 
 
 
298 aa  201  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0266  tryptophan 23-dioxygenase  40.46 
 
 
273 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1080  tryptophan 23-dioxygenase  38.26 
 
 
279 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171749  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6248  tryptophan 23-dioxygenase  42.15 
 
 
294 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39269  normal  0.0912306 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3165  tryptophan 2,3-dioxygenase  41.15 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.78808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3282  tryptophan 23-dioxygenase  40.38 
 
 
265 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1517  tryptophan 23-dioxygenase  39.02 
 
 
260 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3356  tryptophan 23-dioxygenase  40 
 
 
265 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6949  tryptophan 23-dioxygenase  36.6 
 
 
264 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.850321  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.13 
 
 
629 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1862  Tryptophan 2,3-dioxygenase  37.55 
 
 
264 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0590393  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7896  tryptophan 23-dioxygenase  37.31 
 
 
293 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5416  tryptophan 23-dioxygenase  33.98 
 
 
295 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5980  putative tryptophan 2,3-dioxygenase  31.8 
 
 
296 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.121743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3508  tryptophan 23-dioxygenase  32.57 
 
 
262 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0230991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1224  tryptophan 2,3-dioxygenase  36.47 
 
 
267 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0960  Tryptophan 2,3-dioxygenase  41.72 
 
 
369 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0410  tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)-like  27.51 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02822  tryptophan 2,3-dioxygenase  34.32 
 
 
362 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01755  putative tryptophan-2,3-dioxygenase oxidoreductase protein  39.61 
 
 
369 aa  92  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0225  Tryptophan 2,3-dioxygenase  38.62 
 
 
381 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18450  tryptophan 2,3-dioxygenase (vermilion)  23.81 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1409  tryptophan 2,3-dioxygenase  40.71 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.932006  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02610  tryptophan 2,3-dioxygenase family protein  29.52 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0260  Tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)  38.76 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0731  tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)-like protein  35.65 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1013  Tryptophan 2 3-dioxygenase (vermilion)-like protein  34.43 
 
 
308 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0539  hypothetical protein  23.94 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3510  hypothetical protein  26.81 
 
 
441 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0540  hypothetical protein  21.79 
 
 
409 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>