27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0625 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0625  Anti-sigma K factor RskA  100 
 
 		 206 aa  392  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.793553 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0937  putative transmembrane anti-sigma factor  47.06 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  36.89 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1110  hypothetical protein  36.06 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  34.83 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  29.48 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  32.84 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  26.88 
 
 		 274 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  27.92 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  25.39 
 
 		 276 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3257  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.86 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442246  normal  0.111032 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  25.73 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  30.89 
 
 		 258 aa  48.5  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1842  hypothetical protein  29.33 
 
 		 336 aa  46.2  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  21.71 
 
 		 264 aa  45.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  30.21 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  25.96 
 
 		 244 aa  45.1  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  29.41 
 
 		 237 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0511  hypothetical protein  31.13 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.194479  normal  0.142642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4472  hypothetical protein  37.88 
 
 		 297 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  26.14 
 
 		 258 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2946  hypothetical protein  24.02 
 
 		 262 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00896315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1906  hypothetical protein  39.39 
 
 		 287 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1908  hypothetical protein  26.21 
 
 		 277 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  34.38 
 
 		 277 aa  41.6  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  25.21 
 
 		 246 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  37.66 
 
 		 276 aa  41.2  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>