More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1389 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  50.63 
 
 		 653 aa  646    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  50.95 
 
 		 649 aa  649    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  50.31 
 
 		 664 aa  661    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  53.13 
 
 		 655 aa  669    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  72.15 
 
 		 631 aa  979    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  52.66 
 
 		 649 aa  676    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1767  AMP-dependent synthetase and ligase  55.22 
 
 		 650 aa  677    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898058  normal  0.363453 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  73.58 
 
 		 629 aa  977    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  53.33 
 
 		 644 aa  665    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  53.76 
 
 		 657 aa  678    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  54.95 
 
 		 648 aa  704    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  52.5 
 
 		 639 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  50.79 
 
 		 667 aa  654    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  52.54 
 
 		 666 aa  682    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  53.36 
 
 		 651 aa  673    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  52.9 
 
 		 657 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  52.66 
 
 		 656 aa  677    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  52.82 
 
 		 656 aa  677    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  51.33 
 
 		 667 aa  636    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2047  acetyl-coenzyme A synthetase  53.43 
 
 		 651 aa  658    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  52.62 
 
 		 631 aa  670    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  52.31 
 
 		 632 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  70.25 
 
 		 629 aa  951    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  67.26 
 
 		 625 aa  895    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  67.41 
 
 		 629 aa  917    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  72.67 
 
 		 632 aa  992    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  70.93 
 
 		 635 aa  966    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  55.13 
 
 		 626 aa  726    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  53.54 
 
 		 650 aa  661    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  51.57 
 
 		 649 aa  649    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  70.41 
 
 		 629 aa  935    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  53.12 
 
 		 627 aa  669    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  57.48 
 
 		 632 aa  745    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  74.8 
 
 		 631 aa  1023    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  52.54 
 
 		 652 aa  684    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  54.88 
 
 		 636 aa  679    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  52.58 
 
 		 655 aa  662    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  51.81 
 
 		 664 aa  672    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.22 
 
 		 655 aa  677    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  52.12 
 
 		 664 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  51.09 
 
 		 658 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  50.63 
 
 		 657 aa  656    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  50.47 
 
 		 660 aa  635    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  52.06 
 
 		 655 aa  641    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  52.72 
 
 		 639 aa  648    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  56.16 
 
 		 659 aa  660    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  54.39 
 
 		 670 aa  675    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  49.13 
 
 		 652 aa  645    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  52.38 
 
 		 656 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  52.46 
 
 		 632 aa  666    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  54.82 
 
 		 661 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  50.47 
 
 		 667 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  50.95 
 
 		 643 aa  643    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  51.57 
 
 		 650 aa  649    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  53.24 
 
 		 656 aa  668    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  52.72 
 
 		 631 aa  669    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  51.59 
 
 		 667 aa  670    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  50.78 
 
 		 661 aa  635    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  100 
 
 		 632 aa  1306    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  49.85 
 
 		 658 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  50.79 
 
 		 663 aa  634  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  52.11 
 
 		 660 aa  632  1e-180  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  51.48 
 
 		 638 aa  633  1e-180  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  54.7 
 
 		 659 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  50.63 
 
 		 660 aa  630  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  50.56 
 
 		 649 aa  630  1e-179  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  50.94 
 
 		 661 aa  631  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  49.76 
 
 		 657 aa  630  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  51.43 
 
 		 656 aa  628  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  50.81 
 
 		 667 aa  628  1e-178  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  48.41 
 
 		 652 aa  622  1e-177  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  49.69 
 
 		 666 aa  622  1e-177  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  47.77 
 
 		 652 aa  623  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  48.09 
 
 		 652 aa  622  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  51.66 
 
 		 656 aa  623  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  49.34 
 
 		 638 aa  621  1e-176  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  51.32 
 
 		 651 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  51.45 
 
 		 668 aa  617  1e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  50.17 
 
 		 658 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  50 
 
 		 658 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  49.38 
 
 		 673 aa  616  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  50.46 
 
 		 715 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  49.59 
 
 		 636 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  48.68 
 
 		 655 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  49.59 
 
 		 636 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  51.77 
 
 		 670 aa  615  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  48.68 
 
 		 655 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  50.62 
 
 		 661 aa  611  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  49.43 
 
 		 636 aa  611  1e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  53.06 
 
 		 653 aa  609  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  49.21 
 
 		 661 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  49.38 
 
 		 657 aa  608  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  48.13 
 
 		 660 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  49.59 
 
 		 662 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  51.3 
 
 		 663 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  48.6 
 
 		 660 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  48.75 
 
 		 660 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  52.56 
 
 		 654 aa  599  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2952  acetyl-CoA synthetase  48.88 
 
 		 649 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  50 
 
 		 658 aa  600  1e-170  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>