More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0535 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  769    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3232  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 392 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 425 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 424 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  26.12 
 
 		 424 aa  96.7  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 423 aa  95.5  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 421 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  26.53 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  28.16 
 
 		 440 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06387  MFS amine transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10790)  25.12 
 
 		 525 aa  89.7  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 416 aa  89.7  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 396 aa  89.7  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 383 aa  87  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 415 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 395 aa  86.7  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 385 aa  86.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  25.46 
 
 		 417 aa  86.3  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  26.72 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  26.32 
 
 		 381 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  26.72 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  26.32 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  32.76 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07351  conserved hypothetical protein  25.19 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.227764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  29.47 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  25.91 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  28 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.49 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  24.61 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  25.91 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 384 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  25.91 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  24.61 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  24.35 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  25.51 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  24.35 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  24.35 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  24.35 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  24.35 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  25.1 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  24.61 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  24.35 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 503 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 		 538 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  29.01 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  29.01 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5690  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 516 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0856329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 520 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  29.31 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  29.31 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  29.31 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>