More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0205 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0205  nucleotidyl transferase  100 
 
 
262 aa  526  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1181  nucleotidyl transferase  71.97 
 
 
246 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0563368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.6 
 
 
397 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.18 
 
 
349 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.66 
 
 
355 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.07 
 
 
355 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  33.07 
 
 
396 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.84 
 
 
357 aa  149  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.27 
 
 
355 aa  148  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.2 
 
 
344 aa  146  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.86 
 
 
376 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.51 
 
 
357 aa  143  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17370  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.56 
 
 
304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.4 
 
 
357 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.4 
 
 
358 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  35.15 
 
 
358 aa  135  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.6 
 
 
357 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  37.55 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.27 
 
 
355 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0625  UDP-glucose pyrophosphorylase  34.46 
 
 
289 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0556323  normal  0.764647 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0899  UDP-glucose pyrophosphorylase  35.56 
 
 
312 aa  133  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0102571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4112  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  33.21 
 
 
289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0241424  hitchhiker  0.000234521 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.82 
 
 
358 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  33.89 
 
 
405 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2813  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.07 
 
 
307 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0745  putative UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  37.45 
 
 
318 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143994  normal  0.727041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.34 
 
 
355 aa  131  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.04 
 
 
357 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0692  nucleotidyl transferase  37.21 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.777421 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.03 
 
 
359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1369  UDP-glucose pyrophosphorylase  35.85 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.89 
 
 
357 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1080  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  36.71 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.610005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6321  Nucleotidyl transferase  35.74 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.89 
 
 
357 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.17 
 
 
355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3113  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  33.95 
 
 
279 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0116058  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1351  Nucleotidyl transferase  35.44 
 
 
257 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397002  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2189  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  33.33 
 
 
301 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3101  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  34.59 
 
 
288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  35.29 
 
 
400 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.33 
 
 
364 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1612  UDP-glucose pyrophosphorylase  36.95 
 
 
290 aa  129  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0448  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  33.1 
 
 
289 aa  129  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0735  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  33.83 
 
 
273 aa  129  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.561039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2980  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase and type  33.58 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.903558  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.13 
 
 
354 aa  128  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  34.71 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.19 
 
 
405 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.33 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.02 
 
 
355 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.02 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  36.4 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.33 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2225  UDP-glucose pyrophosphorylase  33.82 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1970  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  35.51 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4514  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  33.81 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0937  nucleotidyl transferase  34.19 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3536  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  33.96 
 
 
279 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0740313 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4605  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.08 
 
 
295 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3079  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  37.55 
 
 
292 aa  126  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.3173  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.07 
 
 
357 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1782  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  35.77 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.210122 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.9 
 
 
240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1583  UDP-glucose pyrophosphorylase  33.09 
 
 
288 aa  125  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000105274  unclonable  3.59337e-23 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2905  UDP-glucose pyrophosphorylase  37.87 
 
 
310 aa  125  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0966738  hitchhiker  0.0003639 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0044  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  33.09 
 
 
289 aa  125  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6276  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  33.09 
 
 
293 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1973  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  33.45 
 
 
305 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09229  normal  0.531021 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1690  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.05 
 
 
293 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.87 
 
 
400 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23880  UDP-glucose pyrophosphorylase  35.56 
 
 
325 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3248  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  33.45 
 
 
294 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1668  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.05 
 
 
293 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0926  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.05 
 
 
293 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0423  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.05 
 
 
293 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0740  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.05 
 
 
293 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1121  UDP-glucose pyrophosphorylase  37.45 
 
 
295 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1845  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.05 
 
 
293 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3261  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  33.45 
 
 
294 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  34.02 
 
 
253 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03707  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.03 
 
 
297 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1592  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  33.58 
 
 
293 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414437  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  36.44 
 
 
245 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2634  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.05 
 
 
294 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4040  UDP-glucose pyrophosphorylase  36.76 
 
 
348 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1459  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.05 
 
 
293 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1334  UDP-glucose pyrophosphorylase  33.09 
 
 
293 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0372  UDP-glucose pyrophosphorylase  33.83 
 
 
304 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3821  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.63 
 
 
279 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1949  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.63 
 
 
279 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.376857  normal  0.490446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2237  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase protein  32.06 
 
 
289 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  33.76 
 
 
245 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2353  UDP-glucose pyrophosphorylase  33.58 
 
 
279 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120301  hitchhiker  0.00612692 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0060  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.57 
 
 
291 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.858271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3268  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  36.22 
 
 
296 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0487  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.07 
 
 
314 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0251732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0469  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.07 
 
 
314 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2800  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.73 
 
 
293 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2073  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.21 
 
 
296 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>