More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5112 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_5112  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
274 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102718  normal  0.649242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4649  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
274 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal  0.29144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5190  enoyl-CoA hydratase  93.8 
 
 
274 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00117238  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2913  enoyl-CoA hydratase  74.06 
 
 
270 aa  350  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.944224  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1160  enoyl-CoA hydratase  72.73 
 
 
264 aa  308  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2770  enoyl-CoA hydratase  71.32 
 
 
263 aa  308  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  57.71 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 
261 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5727  enoyl-CoA hydratase  58.76 
 
 
265 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0364977  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1475  enoyl-CoA hydratase  59.49 
 
 
265 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1773  enoyl-CoA hydratase  64.15 
 
 
263 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 
260 aa  238  9e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  47.45 
 
 
262 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  49.22 
 
 
259 aa  235  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
259 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.27 
 
 
262 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2157  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 
257 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  42.35 
 
 
271 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
252 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1330  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.64 
 
 
275 aa  185  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.71221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 
254 aa  178  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.351238 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6416  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.77 
 
 
254 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 
260 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 
251 aa  158  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 
273 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 
265 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 
265 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.5 
 
 
260 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
267 aa  149  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
266 aa  149  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.26 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
262 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 
258 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.96 
 
 
265 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 
274 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.25 
 
 
263 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
260 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  33.22 
 
 
269 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  37.78 
 
 
260 aa  143  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
267 aa  143  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
254 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.31 
 
 
261 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.65 
 
 
659 aa  142  6e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.65 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.13 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.08 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.08 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
265 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.8 
 
 
258 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.78 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
269 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
258 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 
255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.15 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 
254 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
260 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 
259 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 
260 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
260 aa  135  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
258 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  36.09 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 
259 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.84 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
260 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1307  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 
262 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.54 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 
258 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 
280 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0240  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 
265 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
260 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
261 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0281  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11671  normal  0.186449 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.13 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
259 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
268 aa  129  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 
259 aa  128  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>