More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1511 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 374 aa  754    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  99.73 
 
 		 374 aa  751    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  69.44 
 
 		 370 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  69.71 
 
 		 369 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  58.28 
 
 		 378 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  52.92 
 
 		 399 aa  360  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  51.32 
 
 		 387 aa  348  9e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  47.61 
 
 		 400 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  44.94 
 
 		 400 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  47.61 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  47.89 
 
 		 406 aa  342  9e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  46.2 
 
 		 388 aa  341  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  49.6 
 
 		 387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  50.4 
 
 		 381 aa  339  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  51.88 
 
 		 387 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  48.26 
 
 		 383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  48.41 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  50.58 
 
 		 382 aa  334  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  47.23 
 
 		 391 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  50 
 
 		 388 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  50.86 
 
 		 392 aa  328  8e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  52.14 
 
 		 378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  46.4 
 
 		 387 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  51.96 
 
 		 382 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  51.13 
 
 		 383 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  48.91 
 
 		 391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  47.2 
 
 		 381 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  48.99 
 
 		 410 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  47.9 
 
 		 381 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  48.31 
 
 		 381 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  48.02 
 
 		 382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  48.02 
 
 		 383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  46.92 
 
 		 405 aa  312  7.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  47.11 
 
 		 430 aa  310  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  44.81 
 
 		 432 aa  309  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  44.54 
 
 		 428 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  46.09 
 
 		 376 aa  308  9e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  44.26 
 
 		 428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  48.25 
 
 		 374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  46.67 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  45.27 
 
 		 375 aa  302  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  45.41 
 
 		 373 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  44.27 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  45.82 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  45.48 
 
 		 413 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  45.71 
 
 		 360 aa  298  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  47.48 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  43.32 
 
 		 375 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  43.22 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  45.89 
 
 		 371 aa  293  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  45.89 
 
 		 371 aa  293  5e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  46.26 
 
 		 371 aa  292  6e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  46.26 
 
 		 371 aa  292  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  46.26 
 
 		 371 aa  292  6e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  43.01 
 
 		 418 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  44.81 
 
 		 407 aa  292  7e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  44.05 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  46.26 
 
 		 371 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  45.98 
 
 		 371 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  44.85 
 
 		 412 aa  290  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  46.26 
 
 		 371 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  43.17 
 
 		 395 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  43.44 
 
 		 395 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  45.43 
 
 		 384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  42.59 
 
 		 376 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  44.31 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  45.98 
 
 		 396 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  44.74 
 
 		 396 aa  286  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  46.31 
 
 		 394 aa  284  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  41.4 
 
 		 377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  47.14 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1163  glucose sorbosone dehydrogenase  41.76 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  45.33 
 
 		 392 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  44.89 
 
 		 372 aa  280  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  43.4 
 
 		 465 aa  278  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  44.54 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1327  glucose sorbosone dehydrogenase  43.84 
 
 		 377 aa  278  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  44.74 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  45.38 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  46.74 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1774  glucose sorbosone dehydrogenase  45.33 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490744  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  43.54 
 
 		 397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  39.42 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  41.95 
 
 		 411 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  39.62 
 
 		 407 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  41.6 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2476  glucose sorbosone dehydrogenase  45.53 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.534661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  40.48 
 
 		 368 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  40.64 
 
 		 408 aa  269  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  41.55 
 
 		 379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  41.38 
 
 		 376 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  40.1 
 
 		 382 aa  265  8e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2109  glucose sorbosone dehydrogenase  43.91 
 
 		 378 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1838  glucose sorbosone dehydrogenase  41.88 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1619  glucose sorbosone dehydrogenase  44.7 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  41.03 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  41.51 
 
 		 415 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  38.66 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  43.65 
 
 		 402 aa  259  4e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  41.29 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>