More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2445 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2445  response regulator receiver  100 
 
 
125 aa  249  7e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.942791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 
231 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  45.6 
 
 
240 aa  105  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 
231 aa  104  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
166 aa  103  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  45 
 
 
231 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 
237 aa  102  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 
239 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 
223 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4716  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 
223 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 
223 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  45 
 
 
231 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 
227 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0623  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 
223 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0496  response regulator  44.83 
 
 
223 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0498  response regulator  44.83 
 
 
223 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 
229 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0641  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 
223 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0650  DNA-binding response regulator  43.97 
 
 
223 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  39.34 
 
 
243 aa  101  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
234 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
232 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  42.86 
 
 
234 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0711  DNA-binding response regulator  43.97 
 
 
223 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  43.7 
 
 
239 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
232 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  43.7 
 
 
239 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
232 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
232 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 
223 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.7 
 
 
239 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
232 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
232 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  43.7 
 
 
239 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.7 
 
 
239 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
232 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  43.7 
 
 
239 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  43.7 
 
 
239 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
232 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  43.7 
 
 
239 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 
235 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  43.7 
 
 
239 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  40.98 
 
 
229 aa  100  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0499  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 
223 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 
406 aa  100  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 
223 aa  100  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 
232 aa  100  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  44.54 
 
 
236 aa  99.4  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
239 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 
242 aa  99.8  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  38.33 
 
 
247 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 
239 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 
236 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 
229 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 
236 aa  99.8  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 
246 aa  99.4  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  39.66 
 
 
236 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 
239 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 
239 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 
232 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 
239 aa  98.6  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 
225 aa  98.6  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 
243 aa  99  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4665  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.28 
 
 
235 aa  98.6  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.209776 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 
223 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 
233 aa  99  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 
224 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 
234 aa  99  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 
228 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 
273 aa  98.6  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 
234 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 
223 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.92 
 
 
247 aa  98.6  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 
229 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 
223 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 
223 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 
223 aa  98.2  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 
223 aa  97.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 
223 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  39.84 
 
 
241 aa  97.8  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 
235 aa  97.8  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 
223 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 
232 aa  97.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 
232 aa  98.2  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 
223 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 
231 aa  97.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 
223 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
227 aa  97.8  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
234 aa  97.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 
235 aa  97.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 
232 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 
227 aa  97.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  46.09 
 
 
225 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  40 
 
 
225 aa  96.7  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0618  DNA-binding response regulator  46.09 
 
 
225 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  46.09 
 
 
225 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 
230 aa  96.7  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 
237 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0563  response regulator  46.09 
 
 
225 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0708  DNA-binding response regulator  46.09 
 
 
225 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.675964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>