More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0999 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  51.56 
 
 
657 aa  646    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  52.92 
 
 
647 aa  655    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  52.77 
 
 
645 aa  663    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
652 aa  652    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  52.17 
 
 
638 aa  698    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  49.53 
 
 
644 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  50.54 
 
 
662 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  51.22 
 
 
660 aa  639    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
648 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  51.71 
 
 
657 aa  648    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  53.72 
 
 
651 aa  655    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
650 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  51.04 
 
 
656 aa  641    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  51.26 
 
 
645 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  52.76 
 
 
654 aa  683    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  52.27 
 
 
653 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  54.33 
 
 
656 aa  725    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  54.77 
 
 
658 aa  731    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  49.85 
 
 
660 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  52.83 
 
 
655 aa  687    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  51.62 
 
 
652 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  59.17 
 
 
657 aa  778    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  54 
 
 
715 aa  734    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  53.36 
 
 
657 aa  722    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  49.35 
 
 
652 aa  649    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2725  acetyl-CoA synthetase  50.7 
 
 
650 aa  635    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.469585  hitchhiker  0.000676798 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  57.6 
 
 
660 aa  752    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  52.94 
 
 
667 aa  696    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  55.15 
 
 
673 aa  731    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  52.23 
 
 
666 aa  711    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  54.84 
 
 
657 aa  724    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  51.87 
 
 
657 aa  650    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.75 
 
 
661 aa  697    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  53.16 
 
 
653 aa  723    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  56.24 
 
 
660 aa  770    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  57.43 
 
 
660 aa  750    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  56.6 
 
 
656 aa  749    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  51.17 
 
 
646 aa  656    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  51.1 
 
 
629 aa  649    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  51.67 
 
 
631 aa  668    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  50.23 
 
 
667 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  51.1 
 
 
652 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  52.9 
 
 
651 aa  645    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  52.47 
 
 
629 aa  661    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3921  acetyl-CoA synthetase  51.46 
 
 
652 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  50.63 
 
 
629 aa  647    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  53.08 
 
 
661 aa  718    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  49.61 
 
 
650 aa  649    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  51.46 
 
 
654 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  51.46 
 
 
652 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  52.25 
 
 
649 aa  706    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  100 
 
 
649 aa  1343    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  52.95 
 
 
657 aa  719    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  50.76 
 
 
660 aa  638    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  50.93 
 
 
649 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  53.72 
 
 
651 aa  656    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  51.83 
 
 
654 aa  640    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  49.77 
 
 
660 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  55.75 
 
 
652 aa  738    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  55.37 
 
 
655 aa  736    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  52.17 
 
 
666 aa  695    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  53.51 
 
 
653 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  52.17 
 
 
660 aa  696    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  56.66 
 
 
644 aa  751    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  55.37 
 
 
660 aa  734    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  52.03 
 
 
654 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  59.63 
 
 
655 aa  774    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  55.13 
 
 
658 aa  745    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  51.18 
 
 
653 aa  642    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  50.63 
 
 
645 aa  653    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  50.84 
 
 
657 aa  650    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  51.57 
 
 
632 aa  649    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  49.61 
 
 
650 aa  656    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.92 
 
 
658 aa  734    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1791  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 
650 aa  638    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  51.1 
 
 
645 aa  659    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  51.29 
 
 
673 aa  640    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  50.6 
 
 
676 aa  661    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  57.3 
 
 
660 aa  746    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  59.54 
 
 
656 aa  786    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  51.74 
 
 
659 aa  646    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  51.83 
 
 
670 aa  686    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  49.54 
 
 
660 aa  671    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  53.75 
 
 
650 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  49.92 
 
 
656 aa  652    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  53.58 
 
 
644 aa  667    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
650 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  53.36 
 
 
657 aa  723    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  52.39 
 
 
667 aa  714    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  53.58 
 
 
638 aa  682    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  54.55 
 
 
664 aa  707    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  50.93 
 
 
651 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  52.15 
 
 
631 aa  670    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  52.17 
 
 
660 aa  696    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  52.03 
 
 
663 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  50.62 
 
 
649 aa  635    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  52.61 
 
 
661 aa  682    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  51.42 
 
 
645 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  50.46 
 
 
664 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  55.15 
 
 
658 aa  741    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>