199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1366 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1366  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  685    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  32.65 
 
 		 363 aa  202  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1259  protein of unknown function UPF0118  28.92 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.324845  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0113  hypothetical protein  32.38 
 
 		 346 aa  159  7e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0968389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2465  protein of unknown function UPF0118  27.33 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1144  protein of unknown function UPF0118  29.36 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3764  protein of unknown function UPF0118  27.6 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  26.96 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  26.81 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1581  protein of unknown function UPF0118  32.68 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0769558 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  24.56 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  25.44 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  23.26 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  24.85 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  29.7 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  22.8 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2097  protein of unknown function UPF0118  25.3 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.987772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  25.95 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  23.08 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  28.57 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  29.69 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  23.88 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  27.89 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  28.87 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  28.87 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  27.89 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  27.89 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  27.89 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  27.89 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  27.89 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  27.89 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  26.3 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  29.84 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  27.89 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  29.69 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  26.96 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  27.49 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  28.87 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  28.35 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  28.35 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  28.35 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  30.11 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  26.33 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  26.09 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  28.42 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  26.09 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  23.27 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  29.69 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  23.73 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  23.41 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0738  acid membrane antigen A  30 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.444287  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  30.73 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  27.01 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  28.95 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  25.15 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  28.04 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  22.73 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  24.86 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  27.36 
 
 		 393 aa  67  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  23.25 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  24.78 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  24.9 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  24.68 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0472  acid membrane antigen A  27.82 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  29.32 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  25.93 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  25.93 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  27.59 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  24.1 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  22.42 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  28.29 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  27 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  27.59 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  25.2 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  24.93 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  25.26 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  25.14 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  26.38 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  23.72 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  25.23 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  27.81 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  25.23 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  21.23 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  28.14 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  25.73 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  21.36 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  24.34 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  24.35 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  28.33 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  25.4 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  23.41 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  21.39 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  25.95 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  22.86 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  28.26 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0785  hypothetical protein  27.27 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  21.66 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  30.47 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  28.49 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>