More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1168 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  100 
 
 
265 aa  534  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  41.9 
 
 
350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2640  ABC transporter related  40.98 
 
 
278 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2087  ABC transporter related  40.3 
 
 
282 aa  206  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  40.23 
 
 
271 aa  205  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0353  ABC transporter related  43.08 
 
 
280 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  40.65 
 
 
262 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.256722 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35290  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  42.75 
 
 
271 aa  202  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal  0.462856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4922  ABC transporter related  42.02 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  41.63 
 
 
273 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  40.3 
 
 
273 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1455  ABC transporter related  42.17 
 
 
259 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  42.34 
 
 
257 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  42.34 
 
 
257 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  42.34 
 
 
257 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0238  ABC transporter related  40.24 
 
 
268 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.904203  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0985  ABC transporter related protein  40.31 
 
 
263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0610  ABC transporter related protein  40.32 
 
 
248 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.594594  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  39.15 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0603  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.62 
 
 
274 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0755  ABC transporter related  42.62 
 
 
274 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.20195 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0748  Mn2+/Zn2+ ABC transporter ATPase  37.92 
 
 
296 aa  177  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.966679  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2625  ABC transporter related  40.68 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1991  ABC transporter related  40.68 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2601  ABC transporter related  40.68 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1028  ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 
290 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0822349  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5932  ABC heavy metal transporter, ATPase subunit  40.3 
 
 
296 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0689  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.55 
 
 
302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0865  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 
286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0869  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 
286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2649  ABC transporter related  40 
 
 
296 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0327  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.55 
 
 
286 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0625  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 
286 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2517  ABC transporter related  40.3 
 
 
296 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.328547 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2459  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 
286 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0073  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 
286 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2478  ABC transporter related  39.92 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0716  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, ATPase subunit  38.06 
 
 
315 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905635  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3250  ABC transporter related  37.69 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.811224  normal  0.498578 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  33.74 
 
 
254 aa  163  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0696  ABC transporter related  39.62 
 
 
295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.638855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0486  ABC transporter related  39.83 
 
 
309 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0680006  hitchhiker  0.00154743 
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.96 
 
 
254 aa  155  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 
249 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  31.74 
 
 
249 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  35.95 
 
 
262 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1135  ATPase  35.95 
 
 
421 aa  149  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.374033  normal  0.227366 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  35.22 
 
 
427 aa  149  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 
255 aa  148  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  34.82 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  32.93 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  35.56 
 
 
239 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  38.07 
 
 
257 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  34.58 
 
 
271 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  32.49 
 
 
246 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  33.88 
 
 
262 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1957  ABC transporter related  38.49 
 
 
281 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  35.92 
 
 
251 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  33.04 
 
 
249 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0125  ABC transporter related protein  32.68 
 
 
250 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  33.62 
 
 
257 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  33.04 
 
 
249 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  33.06 
 
 
252 aa  143  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  34.82 
 
 
250 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  32.65 
 
 
269 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  35.18 
 
 
254 aa  142  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  33.61 
 
 
258 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  38.91 
 
 
250 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  37.6 
 
 
257 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  34.58 
 
 
259 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  33.61 
 
 
258 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  34.44 
 
 
262 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0584  ABC transporter related protein  33.61 
 
 
259 aa  142  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  32.9 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3057  ATP-binding component of citrate-dependent iron (III) transport protein  33.6 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  33.33 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  33.2 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  30.99 
 
 
254 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  33.74 
 
 
262 aa  139  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  38.66 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  32.9 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  34.69 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  31.51 
 
 
254 aa  139  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  35.24 
 
 
268 aa  138  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  32.92 
 
 
287 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1088  H+-transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit  33.46 
 
 
299 aa  138  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  30.51 
 
 
254 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  33.49 
 
 
281 aa  137  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1231  ABC transporter related  33.47 
 
 
275 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  34.39 
 
 
255 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  30.54 
 
 
261 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1596  ABC transporter-like protein  36.89 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309069  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  31.82 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  32.22 
 
 
243 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  37.56 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  33.2 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>