26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0830 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0830  putative transcriptional regulator  100 
 
 
478 aa  957    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.702449 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0527  hypothetical protein  27.87 
 
 
429 aa  140  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2059  putative transcriptional regulator  31.49 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00686529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  30.71 
 
 
389 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  32.17 
 
 
377 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 
455 aa  56.2  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  28.67 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  31.47 
 
 
377 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 
467 aa  53.9  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  30 
 
 
485 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  28.3 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  27.64 
 
 
138 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 
374 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  27.82 
 
 
225 aa  48.5  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 
494 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  25.78 
 
 
423 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 
462 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
241 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 
230 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  26.26 
 
 
160 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0557  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 
360 aa  45.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 
223 aa  45.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4332  AAA-4 family protein  26.23 
 
 
777 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1016  putative transcriptional regulator  24.17 
 
 
396 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  24.48 
 
 
382 aa  43.9  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  24.6 
 
 
208 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>