More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0164 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0164  ABC transporter related  100 
 
 
275 aa  565  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2790  ABC transporter related protein  48.66 
 
 
268 aa  265  7e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  46.09 
 
 
260 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.58 
 
 
251 aa  243  3e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  46.56 
 
 
259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.57 
 
 
254 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.4 
 
 
254 aa  242  5e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  46.56 
 
 
259 aa  241  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.17 
 
 
254 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.56 
 
 
259 aa  241  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21980  ABC transporter, ATP binding component  45.78 
 
 
271 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.56 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  44.06 
 
 
263 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  49 
 
 
267 aa  238  9e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  42.58 
 
 
261 aa  237  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45.38 
 
 
259 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 
261 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 
259 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.6 
 
 
258 aa  234  9e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  45.06 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  46.36 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  46.51 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  47.77 
 
 
267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  45.98 
 
 
304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  46.34 
 
 
301 aa  233  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.67 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.8 
 
 
288 aa  232  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0928841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  49.56 
 
 
264 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.91 
 
 
267 aa  231  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.64 
 
 
258 aa  231  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  40.5 
 
 
297 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0832  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.87 
 
 
266 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0180389 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  44.32 
 
 
295 aa  230  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.88 
 
 
289 aa  229  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  45.88 
 
 
267 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  44.06 
 
 
261 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 
260 aa  229  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05590  hypothetical protein  43.31 
 
 
278 aa  228  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  43.65 
 
 
304 aa  228  9e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  45.22 
 
 
256 aa  228  9e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  44.62 
 
 
307 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.15 
 
 
285 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001609  nitrate ABC transporter ATP-binding protein  43.31 
 
 
278 aa  227  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.27 
 
 
263 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.27 
 
 
267 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
281 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.15 
 
 
285 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 
254 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  42.69 
 
 
286 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  43.82 
 
 
274 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.83 
 
 
304 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  42.46 
 
 
303 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1390  NO3-/NO2- ABC transporter  43.08 
 
 
266 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  43.68 
 
 
259 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  46.67 
 
 
267 aa  225  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  46.34 
 
 
291 aa  224  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  43.93 
 
 
308 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  42.69 
 
 
286 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  53.59 
 
 
280 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  43.95 
 
 
278 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  44.83 
 
 
283 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  41.9 
 
 
271 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  44.05 
 
 
263 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4456  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.53 
 
 
280 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458938  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0325  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.87 
 
 
268 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.75 
 
 
252 aa  223  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4393  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.53 
 
 
280 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  45.76 
 
 
272 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.54 
 
 
280 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  45.96 
 
 
265 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  45.76 
 
 
272 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  44.66 
 
 
260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  42.8 
 
 
271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0962  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.88 
 
 
304 aa  222  6e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.439268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  45.34 
 
 
292 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  44.44 
 
 
265 aa  221  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.2 
 
 
277 aa  221  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.38 
 
 
252 aa  221  8e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  43.03 
 
 
306 aa  221  9e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.7 
 
 
278 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  43.58 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  43.08 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.04 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  47.71 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  42.58 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3314  putative nitrate ABC transporter, ATP-binding protein  43.92 
 
 
292 aa  219  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.662783  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.69 
 
 
267 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  43.53 
 
 
256 aa  219  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  44.59 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45 
 
 
337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  42.69 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  42.69 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0379  putative nitrate ATP-binding ABC transporter protein  43.08 
 
 
268 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.95656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  43.13 
 
 
259 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  46.35 
 
 
303 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  46.35 
 
 
303 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>