43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2886 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  100 
 
 		 322 aa  625  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  62.28 
 
 		 281 aa  347  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  25.39 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  25.5 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  24.08 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  22.92 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  25.35 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  26.55 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  26.71 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  22.97 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  24.45 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  26.97 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  27.21 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  24.69 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  24.69 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  22.86 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  22.19 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  26.96 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  24.14 
 
 		 386 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  29.13 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  25.93 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 586 aa  53.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  22.26 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  22.91 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  35.16 
 
 		 320 aa  49.7  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  34.71 
 
 		 392 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  22.82 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  21.5 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  22.34 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  29.66 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  30.25 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  25.69 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2265  hypothetical protein  24.76 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  24.23 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10206  transmembrane protein  33.72 
 
 		 427 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.652566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  25.08 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  24.06 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  30.7 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  25.38 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  29.9 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  26.17 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  29.82 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  40 
 
 		 859 aa  42.4  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>