More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1885 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  100 
 
 
254 aa  518  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.84 
 
 
254 aa  329  3e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000055289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2391  hypothetical protein  50.41 
 
 
262 aa  260  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0511  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.2 
 
 
249 aa  258  9e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357895  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0059  CODH nickel-insertion accessory protein  47.17 
 
 
271 aa  251  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0244  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.29 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0713791  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2510  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.95 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.510145  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1780  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.93 
 
 
259 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.183966  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.93 
 
 
259 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.886751  normal  0.0311446 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0606  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.93 
 
 
259 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0506  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.13 
 
 
258 aa  174  9e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1413  nitrogenase reductase related protein  39.92 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0342  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.72 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  37.5 
 
 
212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1428  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.22 
 
 
263 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.489476  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4497  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.44 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3793  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.95 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0543422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1010  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.34 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4099  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.9 
 
 
254 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0554  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0371044  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04470  Carbon monoxide dehydrogenae assesory protein, CooC  31.71 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.788733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0074  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.51 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.98 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.82 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1235  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.3 
 
 
258 aa  105  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00902647  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0692  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.84 
 
 
259 aa  105  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00303671  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1681  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.39 
 
 
260 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00843819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0219  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.65 
 
 
260 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.321933  normal  0.962999 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.18 
 
 
281 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.810765  normal  0.749714 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0933  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
258 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.7514  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.31 
 
 
249 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.71 
 
 
274 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0303  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.51 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0846  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.25 
 
 
300 aa  98.6  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0221899  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 
272 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1375  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.05 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.316103 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1269  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 
253 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.328604  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0308  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.53 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0704532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0617  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  29.95 
 
 
290 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0224  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.09 
 
 
250 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.534474  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1676  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.09 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3029  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  29.25 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.69 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1029  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.96 
 
 
252 aa  89.4  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.554413  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0802  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.17 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1132  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.74 
 
 
293 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382082  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0381  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 
275 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0808  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.35 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131067  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.55 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000754699  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0107  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
251 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0058  CO dehydrogenase maturation factor  27.5 
 
 
290 aa  82  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000462787  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2232  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein CooC, putative  27.72 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.25 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2256  CODH nickel-insertion accessory protein  30.4 
 
 
223 aa  77  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1274  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.36 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000167527  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1191  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0163515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000822608  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1313  CODH nickel-insertion accessory protein  36.89 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.880069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2794  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
251 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2097  carbon monoxide dehydrogenase accessory protein, putative  27 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0201  nitrogenase iron protein  30.48 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000834701  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2777  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.5 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  30.43 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.1 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2919  hypothetical protein  39.02 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.502344  hitchhiker  0.000212712 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.14 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0874  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.05 
 
 
258 aa  67  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  28.1 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.42 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1096  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.66 
 
 
265 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0669  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  26.09 
 
 
260 aa  62  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0703  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  26.09 
 
 
260 aa  62  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  28.5 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  26.12 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_607  carbon monoxide dehydrogenase nickel-insertion accessory protein  26.09 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0260  septum site-determining protein MinD  25.7 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.148495  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.13 
 
 
146 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1628  septum site-determining protein MinD  25.51 
 
 
269 aa  59.7  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000684278  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0502  septum site-determining protein MinD  28.11 
 
 
271 aa  60.1  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0531405 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0638  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  25.54 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0072  hypothetical protein  24.76 
 
 
325 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3342  septum site-determining protein MinD  24.7 
 
 
268 aa  58.9  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3507  cell division inhibitor  27.51 
 
 
271 aa  58.9  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00615597  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  29.77 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0322  septum site-determining protein MinD  28.15 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0928879  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1991  septum site-determining protein MinD  28.49 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0691  CODH nickel-insertion accessory protein  25.11 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.071672  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1281  septum site-determining protein MinD  26.75 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0634588  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2113  septum site-determining protein MinD  25.51 
 
 
269 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000128974  normal  0.232041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1558  septum site-determining protein MinD  30.46 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.859979  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  28.28 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1703  septum site-determining protein MinD  25.59 
 
 
272 aa  56.6  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0926  septum site-determining protein MinD  25.61 
 
 
269 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0213983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4886  CO dehydrogenase maturation factor-like protein  26.46 
 
 
327 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7191  hypothetical protein  24.17 
 
 
334 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1809  septum site-determining protein MinD  26.51 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0710931  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1374  CODH nickel-insertion accessory protein  27.23 
 
 
259 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.329731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0633  septum site-determining protein MinD  28.02 
 
 
271 aa  55.8  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2520  septum site-determining protein MinD  25.22 
 
 
269 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147543  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.94 
 
 
250 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>