257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1675 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  472  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  64.32 
 
 		 227 aa  320  8e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  65.65 
 
 		 232 aa  320  8e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  65.91 
 
 		 228 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  64.76 
 
 		 228 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  66.36 
 
 		 227 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  63.35 
 
 		 231 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  62.01 
 
 		 230 aa  305  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  60.87 
 
 		 232 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  62.9 
 
 		 238 aa  302  4.0000000000000003e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  62.11 
 
 		 232 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  62.27 
 
 		 227 aa  300  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  61.23 
 
 		 234 aa  295  3e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  56.77 
 
 		 240 aa  281  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  55.51 
 
 		 234 aa  271  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  52.42 
 
 		 259 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  50.66 
 
 		 230 aa  255  4e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  47.79 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  44.44 
 
 		 232 aa  222  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  44.64 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  45.18 
 
 		 236 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  44.64 
 
 		 232 aa  214  9e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  44.64 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  44.44 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  41.33 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  41.95 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  39.92 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  37.66 
 
 		 236 aa  174  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  40.99 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  39.83 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  38.72 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  38.98 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  26.7 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  27.13 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17110  hydrogenase accessory protein HypB  27.08 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  26.02 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0723  urease accessory protein UreG  27 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  27.55 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2753  urease accessory protein UreG  31.43 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0806758  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  30.18 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1756  urease accessory protein UreG  27.87 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0086861  normal  0.860103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  24.57 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  30.46 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  26.47 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  29.44 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1244  urease accessory protein UreG  27.86 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  28.43 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  28.89 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1556  urease accessory protein UreG  26.01 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4213  urease accessory protein UreG  31.25 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  27.98 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000301925  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  25.63 
 
 		 203 aa  57  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1938  hydrogenase accessory protein HypB  27.27 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  29.02 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  27.55 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  25.88 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  24.86 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  30.05 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4441  urease accessory protein UreG  29 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2165  hydrogenase accessory protein HypB  30.77 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  27.87 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  26.35 
 
 		 352 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  24.32 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  27.55 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  26.4 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03880  hydrogenase accessory protein HypB  25.57 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  27.75 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  24.32 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  26.32 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  28.09 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  27.55 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3533  urease accessory protein UreG  28.16 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.490615 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1946  urease accessory protein UreG  28.48 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00965207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  26.37 
 
 		 321 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2261  urease accessory protein UreG  30 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  24.32 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3107  urease accessory protein UreG  27.41 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0992  urease accessory protein UreG  27.81 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1198  urease accessory protein UreG  29.29 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195176  normal  0.215478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4160  urease accessory protein UreG  27.14 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1813  urease accessory protein UreG  25.89 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0302  urease accessory protein G  28.48 
 
 		 207 aa  52.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  27.92 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  26.29 
 
 		 293 aa  52  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1205  urease accessory protein UreG  28.48 
 
 		 211 aa  52.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  23.7 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2377  urease accessory protein UreG  28.65 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.168299 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1190  urease accessory protein UreG  30.87 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.257386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  27.55 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  24.44 
 
 		 307 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2187  urease accessory protein UreG  29.94 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  32.35 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3115  urease accessory protein UreG  29.94 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3079  urease accessory protein UreG  29.94 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2554  urease accessory protein UreG  29.94 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2060  urease accessory protein UreG  29.94 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0720  urease accessory protein UreG  29.94 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1358  urease accessory protein UreG  28.79 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  28.98 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19201  urease accessory protein UreG  32.21 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>