38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1428 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  100 
 
 		 139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  68.25 
 
 		 126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  59.17 
 
 		 120 aa  154  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  52.89 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  55.65 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  54.78 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  55.17 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  54.78 
 
 		 117 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0634  50S ribosomal protein L18e  53.45 
 
 		 120 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1350  50S ribosomal protein L18e  53.98 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0568  50S ribosomal protein L18e  53.98 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.392216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0270  50S ribosomal protein L18e  53.98 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  51.75 
 
 		 117 aa  127  6e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  46.96 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2550  ribosomal protein L15  47.46 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1820  50S ribosomal protein L18e  46.61 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2520  50S ribosomal protein L18e  47.83 
 
 		 116 aa  114  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2593  ribosomal protein L15  50.43 
 
 		 115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.470627  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0424  ribosomal protein L15  45.76 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1051  ribosomal protein L15  40.98 
 
 		 119 aa  97.8  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128045  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2098  50S ribosomal protein L18e  43.1 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2328  50S ribosomal protein L18e  40.87 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0279  50S ribosomal protein L18e  40.83 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2144  50S ribosomal protein L18e  47.67 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000147154  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0696  50S ribosomal protein L18e  39.13 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0362291  normal  0.101034 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1970  50S ribosomal protein L18e  38.79 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0059589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0427  50S ribosomal protein L15  40 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0179174 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  40 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30315  predicted protein  27.69 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85665  predicted protein  35.24 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  42.31 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  35.23 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33583  Ribosomal protein L18, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  31.52 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07665  normal  0.0789022 
 
 
-
 
NC_006686  CND03460  conserved hypothetical protein  27.5 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  44.68 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  34.09 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  34.12 
 
 		 146 aa  40  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  34.09 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>