More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0788 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  100 
 
 		 233 aa  466  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  62.66 
 
 		 234 aa  295  4e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  47.77 
 
 		 230 aa  205  6e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  49.53 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  48.31 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  52.34 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  46.7 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  50.72 
 
 		 241 aa  184  7e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  47.37 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  49.28 
 
 		 242 aa  181  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  45.74 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  46.57 
 
 		 225 aa  177  9e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  49.51 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  47.34 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  46.57 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  46.08 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  41.28 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  43.52 
 
 		 225 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  42.57 
 
 		 227 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  37.19 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  38.39 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  32.11 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  36.89 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  34.67 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  33.05 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  35.14 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  37.43 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  37.72 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  30.04 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  37.33 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  30.34 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  38.26 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  31.52 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  28.82 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  29.46 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  29.15 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  31.18 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  33.33 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  27.35 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_004310  BR1160  uridylate kinase  34.62 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  31.48 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  30.73 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  32.42 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2031  uridylate kinase  34.62 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  33.89 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1117  uridylate kinase  34.62 
 
 		 323 aa  68.2  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4151  uridylate kinase  32.22 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0537318  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3447  uridylate kinase  32.63 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.345639 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  32.64 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2349  uridylate kinase  32.63 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1538  uridylate kinase  31.1 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  33.71 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2075  uridylate kinase  32.63 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.433019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  32.42 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  34.07 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  36.55 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  34.64 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  31.79 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  33.54 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf053  uridylate kinase  26.27 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  32.91 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  32.91 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  32.91 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  32.91 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  33.54 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  32.91 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1383  uridylate kinase  36.92 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.862612  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  33.54 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  32.91 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  32.91 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  30.73 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  31.32 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0787  uridylate kinase  32.94 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  28.63 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  32.91 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  31.74 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  34.78 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  31.74 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  32.28 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  32.28 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  32.28 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  32.91 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  32.91 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  32.28 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  28.05 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  30.73 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  32.72 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  35.42 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1133  uridylate kinase  32.31 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  28.21 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  35.17 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  32.1 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  31.65 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  31.28 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  32.1 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  32.64 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  28.8 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  33.33 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2524  uridylate kinase  33.08 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831867  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  34.48 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>