More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0220 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 335 aa  693    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0708  ketol-acid reductoisomerase  73.73 
 
 		 335 aa  488  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 		 330 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  64.55 
 
 		 331 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  60.9 
 
 		 338 aa  435  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  65.76 
 
 		 331 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  60.42 
 
 		 331 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  64.31 
 
 		 327 aa  429  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 		 331 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 338 aa  424  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  63.69 
 
 		 344 aa  425  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  58.84 
 
 		 330 aa  425  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  60.66 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  62.62 
 
 		 331 aa  424  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 		 338 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  63.14 
 
 		 341 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 336 aa  421  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  58.86 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0112  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 		 332 aa  424  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 330 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  59.46 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  57.96 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 		 333 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  57.78 
 
 		 338 aa  414  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  65.96 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 330 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  58.26 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  58.26 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  58.56 
 
 		 338 aa  414  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  57.78 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 		 331 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  58.26 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  63.94 
 
 		 331 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  61.88 
 
 		 330 aa  413  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  61.88 
 
 		 330 aa  413  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  58.26 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  61.88 
 
 		 330 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  61.38 
 
 		 337 aa  411  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  57.66 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 		 331 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  66.57 
 
 		 331 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  61.9 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 		 331 aa  408  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  58.26 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 330 aa  408  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2103  ketol-acid reductoisomerase  58.86 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1538  ketol-acid reductoisomerase  60.94 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  61.61 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  57.66 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  57.66 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  58.86 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2891  ketol-acid reductoisomerase  58.86 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0051674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  58.56 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  60.31 
 
 		 330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0636  ketol-acid reductoisomerase  57.61 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  58.08 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  57.62 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  66.26 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  57.93 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  58.56 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0600  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  60.84 
 
 		 333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0611  ketol-acid reductoisomerase  58.08 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0884  ketol-acid reductoisomerase  58.51 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209351  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  57.66 
 
 		 338 aa  401  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 		 336 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0983  ketol-acid reductoisomerase  57.61 
 
 		 338 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.900438  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0873  ketol-acid reductoisomerase  56.13 
 
 		 351 aa  401  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  58.91 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  59.34 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 		 329 aa  401  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 329 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3229  ketol-acid reductoisomerase  58.86 
 
 		 338 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  59.21 
 
 		 331 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2172  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 		 329 aa  402  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  56.27 
 
 		 338 aa  401  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  57.78 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>