35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1639 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  890    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  25.45 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  26.15 
 
 		 537 aa  70.1  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  26.63 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  23.44 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  26.51 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  23.69 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  26.64 
 
 		 444 aa  57  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  23.31 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  22.45 
 
 		 446 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  25.99 
 
 		 461 aa  53.9  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  22.13 
 
 		 425 aa  53.9  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0291  hypothetical protein  26.52 
 
 		 449 aa  53.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  24.39 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  25.7 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  23.74 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  33.05 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  33.05 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  28.02 
 
 		 437 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  27.92 
 
 		 393 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2886  O-antigen ligase-like  26.13 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000199013  normal  0.062273 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  25.54 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  24.74 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  24.44 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  29.01 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  25.1 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  21.82 
 
 		 501 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3150  O-antigen polymerase  27.7 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  27.08 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  26.06 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  25.4 
 
 		 454 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  32.26 
 
 		 432 aa  43.9  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  27.38 
 
 		 465 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  26.87 
 
 		 773 aa  43.5  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  23.39 
 
 		 466 aa  43.1  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>