40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1097 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  100 
 
 
120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0634  50S ribosomal protein L18e  61.67 
 
 
120 aa  157  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1350  50S ribosomal protein L18e  60.83 
 
 
120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0568  50S ribosomal protein L18e  60.83 
 
 
120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.392216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0270  50S ribosomal protein L18e  60.83 
 
 
120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  51.26 
 
 
126 aa  137  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  50.43 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  48.74 
 
 
120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  46.96 
 
 
139 aa  124  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  48.31 
 
 
121 aa  123  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  45.76 
 
 
121 aa  120  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  47.86 
 
 
121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  44.83 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  45.13 
 
 
122 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2550  ribosomal protein L15  44.25 
 
 
117 aa  106  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0424  ribosomal protein L15  43.36 
 
 
117 aa  106  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1820  50S ribosomal protein L18e  43.36 
 
 
117 aa  104  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2593  ribosomal protein L15  42.24 
 
 
115 aa  103  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.470627  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2520  50S ribosomal protein L18e  41.38 
 
 
116 aa  102  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37229  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0427  50S ribosomal protein L15  42.11 
 
 
115 aa  97.1  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0179174 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2098  50S ribosomal protein L18e  45.13 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1970  50S ribosomal protein L18e  45.13 
 
 
122 aa  94  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0059589  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2328  50S ribosomal protein L18e  47.79 
 
 
122 aa  93.6  9e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  45.3 
 
 
119 aa  93.6  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0696  50S ribosomal protein L18e  43.36 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0362291  normal  0.101034 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2144  50S ribosomal protein L18e  38.53 
 
 
117 aa  84.3  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000147154  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0279  50S ribosomal protein L18e  39.84 
 
 
120 aa  84  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1051  ribosomal protein L15  36.36 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128045  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30315  predicted protein  31.36 
 
 
192 aa  54.7  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03460  conserved hypothetical protein  30.58 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85665  predicted protein  34.29 
 
 
186 aa  47  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251069  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05800  60S ribosomal protein L18 (AFU_orthologue; AFUA_2G07380)  30.63 
 
 
184 aa  43.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000000048674 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  34.62 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17321  50S ribosomal protein L15  34.62 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1633  50S ribosomal protein L15  46.67 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0023  50S ribosomal protein L15P  48.72 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000020439  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0586  50S ribosomal protein L15P  28.92 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0135951  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  40 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>