87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1259 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1259  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  44.78 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  43.24 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  35.71 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  51.02 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  53.19 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  53.19 
 
 		 99 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  46.51 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  53.49 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0232  regulatory protein, FmdB family  46.81 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  48.84 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  48.84 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  48.94 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  48.94 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  36.11 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  41.33 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  46.81 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  60.61 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3639  FmdB family regulatory protein  48.94 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  36.11 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  36.11 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  38.46 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  51.16 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  36.62 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  36.11 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  44.68 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  46.51 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  42.86 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  46.81 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  46.51 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  46.81 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  57.58 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  35.62 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  46.81 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0801  regulatory protein, FmdB family  48.94 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  45.24 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0872  FmdB family regulatory protein  53.49 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0440  hypothetical protein  36.59 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  44.44 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  37.7 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  35.48 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  44.44 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  45.65 
 
 		 77 aa  43.9  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  42.55 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  35.71 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  51.16 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  35.71 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  37.88 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  42.55 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  35.71 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  51.43 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  40.98 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  40.98 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  44.19 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000459423  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  42.55 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  40.43 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  40.43 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  41.86 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  40.98 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0572  FmdB family regulatory protein  40.43 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  44.19 
 
 		 85 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  33.8 
 
 		 71 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  44.44 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2782  FmdB family regulatory protein  42.55 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155022  normal  0.0575706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  39.68 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  39.68 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  39.02 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  36.54 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  44.19 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  44.68 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  44.19 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  38.3 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  50 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  38.3 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  35.48 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0195  regulatory protein, FmdB family  43.18 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  34.04 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  51.22 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  40.43 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1727  regulatory protein, FmdB family  44.44 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0359754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  51.43 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  45.65 
 
 		 73 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  37.1 
 
 		 83 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>