More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1101 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  100 
 
 		 476 aa  983    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  58.33 
 
 		 515 aa  527  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1602  multicopper oxidase type 2  52.7 
 
 		 532 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.193989  normal  0.419076 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3367  multicopper oxidase type 2  45.44 
 
 		 539 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  38.49 
 
 		 492 aa  292  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  36.38 
 
 		 499 aa  292  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  36.59 
 
 		 464 aa  286  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  38.29 
 
 		 494 aa  276  5e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  35.12 
 
 		 493 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  36.08 
 
 		 493 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  37.53 
 
 		 492 aa  256  8e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  35.63 
 
 		 515 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  31.82 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  30.87 
 
 		 522 aa  201  3e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  30.06 
 
 		 513 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  30.04 
 
 		 513 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0315  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  31.69 
 
 		 569 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  31.41 
 
 		 483 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  32.2 
 
 		 535 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 		 586 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  30.93 
 
 		 487 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 		 536 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.84 
 
 		 579 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 		 536 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 		 536 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  31.92 
 
 		 533 aa  190  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.51 
 
 		 591 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  31.43 
 
 		 536 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  31.43 
 
 		 536 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  31.87 
 
 		 535 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  32.47 
 
 		 490 aa  187  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  31.57 
 
 		 535 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  31.57 
 
 		 535 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  32.21 
 
 		 531 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4191  multicopper oxidase, types 2 and 3  29.98 
 
 		 556 aa  183  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122598  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  31.58 
 
 		 532 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  32.27 
 
 		 504 aa  173  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  31.77 
 
 		 519 aa  171  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  30.84 
 
 		 486 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  33.56 
 
 		 496 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  31.61 
 
 		 527 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  32.24 
 
 		 508 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3373  multicopper oxidase type 2  28.18 
 
 		 578 aa  153  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  31 
 
 		 515 aa  148  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2333  multicopper oxidase type 2  28.18 
 
 		 636 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2384  multicopper oxidase type 2  28.18 
 
 		 636 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  29.15 
 
 		 569 aa  143  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1869  multicopper oxidase family protein  30.93 
 
 		 321 aa  143  9e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  29.82 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  29.33 
 
 		 502 aa  139  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  29.33 
 
 		 502 aa  139  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  26.8 
 
 		 499 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  29.47 
 
 		 532 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  26.57 
 
 		 533 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  27.23 
 
 		 538 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  27.76 
 
 		 547 aa  133  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  26.99 
 
 		 536 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  26.68 
 
 		 534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  26.68 
 
 		 534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  26.87 
 
 		 516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  27.23 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3429  multicopper oxidase type 3  25.96 
 
 		 688 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00228386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6753  multicopper oxidase type 3  31.15 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000114434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  28.93 
 
 		 528 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6431  multicopper oxidase type 2  25.99 
 
 		 649 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  30.04 
 
 		 506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  29.28 
 
 		 528 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  33.68 
 
 		 570 aa  120  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04807  putative L-ascorbate oxidase  25.21 
 
 		 717 aa  120  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182612  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  27.55 
 
 		 487 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  28.51 
 
 		 478 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  27.78 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  24.87 
 
 		 625 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1496  multicopper oxidase, type 2  28.17 
 
 		 631 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0717064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6131  multicopper oxidase type 3  25.19 
 
 		 646 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.329872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  27.31 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  27.31 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  27.31 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  27.31 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2128  multicopper oxidase, type 2  27.29 
 
 		 582 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  27.12 
 
 		 516 aa  113  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  24.65 
 
 		 519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  26.26 
 
 		 519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  27.6 
 
 		 488 aa  110  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  26.92 
 
 		 516 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  26.92 
 
 		 529 aa  110  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  25.97 
 
 		 535 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  26.63 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  26.63 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  29.87 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  27.6 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  23.81 
 
 		 460 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  25.44 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  25.15 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4180  multicopper oxidase, type 2  25.75 
 
 		 596 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387832  normal  0.310383 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  25.78 
 
 		 523 aa  103  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1407  multicopper oxidase type 2  24.44 
 
 		 730 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266798  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  27.27 
 
 		 511 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  26.12 
 
 		 510 aa  100  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  24.89 
 
 		 679 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>