42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03973 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03973  YceI family protein  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000954749  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1959  hypothetical protein  40.53 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1704  YceI family protein  39.88 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0136  YceI  39.01 
 
 		 198 aa  141  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1651  YceI family protein  37.3 
 
 		 191 aa  138  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2476  YceI family protein  37.36 
 
 		 191 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00617169  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1636  YceI family protein  36.9 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.431474  normal  0.0372178 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1355  YceI  38.74 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1561  YceI family protein  36.9 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2893  hypothetical protein  36.36 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1628  YceI family protein  35.83 
 
 		 191 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.390594  normal  0.0802652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1765  YceI family protein  36.72 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1809  YceI family protein  36.16 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.712609  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2605  YceI family protein  36.65 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.911496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1772  YceI family protein  36.16 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2513  YceI family protein  36.16 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2061  YceI family protein  37.16 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1183  YceI family protein  36.47 
 
 		 195 aa  124  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  0.710564 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2223  YceI family protein  34.55 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.128547  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1131  YceI family protein  35.03 
 
 		 208 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4910  hypothetical protein  35.23 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372677  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4460  YceI family protein  34.71 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111755 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3983  YceI family protein  37.24 
 
 		 198 aa  111  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.812523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0930  YceI family protein  34.12 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0891  YceI family protein  33.73 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56420  hypothetical protein  35.23 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1295  YceI  34.32 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.018481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4045  YceI  33.7 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.033044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0994  YceI family protein  34.32 
 
 		 193 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000032385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4915  hypothetical protein  31.61 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  34.91 
 
 		 371 aa  106  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  36.69 
 
 		 1042 aa  105  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56510  hypothetical protein  31.21 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.844348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2275  YceI  35.09 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000110231  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4350  YceI-like family protein  31.49 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05610  hypothetical protein  29.82 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  28.9 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  24.57 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  29.73 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  27.35 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  27.45 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  26.32 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>