35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01474 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  100 
 
 		 156 aa  305  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  47.65 
 
 		 165 aa  133  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  46.94 
 
 		 152 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  38.46 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  40.41 
 
 		 180 aa  107  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  38.41 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  37.33 
 
 		 175 aa  100  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  39.86 
 
 		 195 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  36.67 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  37.84 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  38.1 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  39.44 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  33.11 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  38.78 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  32.64 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  32.19 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  33.1 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  30.72 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  29.33 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  30.61 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  31.4 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.39 
 
 		 277 aa  48.5  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  27.08 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  28.19 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  30.72 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  27.86 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.76 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  27.33 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  28.06 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>