More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00667 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00667  elongation factor P  100 
 
 		 191 aa  393  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1470  elongation factor P  71.58 
 
 		 190 aa  286  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1465  elongation factor P  71.96 
 
 		 191 aa  286  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2075  elongation factor P  74.74 
 
 		 190 aa  279  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2909  elongation factor P  71.28 
 
 		 188 aa  279  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.059454  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1806  elongation factor P  67.2 
 
 		 191 aa  271  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.97867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2524  elongation factor P  62.63 
 
 		 190 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1536  elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  251  5.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0067814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2821  elongation factor P  63.3 
 
 		 188 aa  250  7e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145694 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0829  elongation factor P  57.45 
 
 		 199 aa  226  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334828  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003095  translation elongation factor P-related protein  52.13 
 
 		 188 aa  214  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000529109  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02751  elongation factor P  52.13 
 
 		 188 aa  214  7e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2429  elongation factor P  53.16 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2766  elongation factor P  54.21 
 
 		 190 aa  204  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2448  elongation factor P  53.68 
 
 		 190 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.264552  hitchhiker  0.000000115844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2405  elongation factor P  53.68 
 
 		 190 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243209 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3237  elongation factor P-like protein YeiP  52.11 
 
 		 190 aa  203  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2562  elongation factor P  53.68 
 
 		 190 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.015045  decreased coverage  0.0000164335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2451  elongation factor P  53.68 
 
 		 190 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.670538 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02101  elongation factor P  53.16 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.535663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1486  elongation factor P-like protein YeiP  53.16 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000827349  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02060  hypothetical protein  53.16 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550135  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1476  elongation factor P  53.16 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00371252  hitchhiker  0.0000156909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3309  elongation factor P  53.16 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000740697  normal  0.0270118 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2320  elongation factor P  53.16 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00968365  hitchhiker  0.00148225 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2469  elongation factor P  53.16 
 
 		 275 aa  201  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000100946  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2309  elongation factor P  53.16 
 
 		 275 aa  201  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000534357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0790  elongation factor P  53.16 
 
 		 253 aa  201  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000299775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2332  elongation factor P-like protein YeiP  51.05 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2777  elongation factor P  51.58 
 
 		 190 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2698  elongation factor P  51.58 
 
 		 190 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1920  elongation factor P  51.58 
 
 		 190 aa  194  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0258895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1649  elongation factor P  51.58 
 
 		 190 aa  193  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0299011  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00104  elongation factor P  49.2 
 
 		 188 aa  181  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.525787  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1798  elongation factor P  49.2 
 
 		 188 aa  180  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108077  normal  0.0755621 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1338  elongation factor P  48.92 
 
 		 188 aa  174  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000294527  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1404  elongation factor P  48.39 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00194767  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0790  elongation factor P/YeiP  43.09 
 
 		 188 aa  171  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0415  elongation factor P  37.77 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00396498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0341  elongation factor P  38.3 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000484075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0550  elongation factor P  37.23 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.38651e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0415  elongation factor P  36.7 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  36.36 
 
 		 189 aa  127  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0465  elongation factor P  35.79 
 
 		 187 aa  124  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000040903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3303  elongation factor P  35.64 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0099  elongation factor P  34.57 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000893399  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  36.36 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0684  elongation factor P  35.64 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1695  elongation factor P  36.51 
 
 		 186 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  35.11 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  39.61 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1082  translation elongation factor P  37.87 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.314487  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  36.17 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  35.87 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  34.57 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  31.52 
 
 		 190 aa  114  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  33.33 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  31.75 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  34.22 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  32.09 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  31.75 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0356  elongation factor P  34.41 
 
 		 194 aa  111  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.142965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  36.36 
 
 		 186 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  32.45 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1421  elongation factor P  32.09 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  33.51 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1061  elongation factor P  34.04 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1051  elongation factor P  34.04 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1061  elongation factor P  34.57 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  31.18 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  32.8 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  34.76 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  31.58 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  34.05 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  33.15 
 
 		 186 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  32.98 
 
 		 187 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  33.69 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  30.73 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  33.88 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  32.09 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  36.6 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0720  elongation factor P  33.93 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000911584  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  33.69 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  34.22 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  32.98 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  32.62 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  33.69 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  30.98 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  31.91 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  32.09 
 
 		 185 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>