More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00123 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00123  cysteine desulfurase  100 
 
 		 373 aa  757    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2092  aminotransferase, class V  56.45 
 
 		 353 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.935088  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  41.21 
 
 		 493 aa  284  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  42.02 
 
 		 404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  42.47 
 
 		 406 aa  280  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  42.44 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 404 aa  278  9e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  40.16 
 
 		 502 aa  276  4e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  41.22 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  42.89 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1122  aminotransferase, class V  41.05 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  42.47 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  42.19 
 
 		 404 aa  275  7e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  43.82 
 
 		 404 aa  275  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1695  aminotransferase class V  43.27 
 
 		 492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  42.67 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5230  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 501 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.500122  normal  0.247226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3511  cysteine desulfurase  41.8 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  41.53 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  41.67 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2002  aminotransferase class V  43.56 
 
 		 492 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.611456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5203  aminotransferase, class V  44.44 
 
 		 494 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00405553  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3365  aminotransferase class V  44.18 
 
 		 494 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  42.59 
 
 		 408 aa  269  7e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  43.32 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  40.58 
 
 		 422 aa  267  2e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5190  aminotransferase class V  42.22 
 
 		 492 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1413  cysteine desulfurase  41.37 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.156038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  43.39 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40400  cysteine desulfurase  41.51 
 
 		 404 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0842  cysteine desulfurase  42.25 
 
 		 404 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0648359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0872  cysteine desulfurase  42.25 
 
 		 404 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2744  hypothetical protein  43.24 
 
 		 492 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1237  cysteine desulfurase  41.44 
 
 		 404 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.781022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  40.49 
 
 		 403 aa  265  8.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  41.98 
 
 		 404 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1423  cysteine desulfurase  41.44 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  42.01 
 
 		 381 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  41.71 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  38.9 
 
 		 400 aa  262  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4612  cysteine desulfurase  39.84 
 
 		 404 aa  262  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0217102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4740  aminotransferase, class V  41.6 
 
 		 492 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3426  aminotransferase, class V  41.6 
 
 		 492 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  42.02 
 
 		 404 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  38.54 
 
 		 388 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  41.49 
 
 		 407 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01356  cysteine desulfurase  41.37 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.350506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  43.01 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2848  aminotransferase, class V  40.75 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  43.56 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  41.11 
 
 		 407 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4091  aminotransferase class V  41.33 
 
 		 492 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  41.76 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  40.32 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  41.11 
 
 		 407 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  40.79 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  41.22 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  40.96 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1961  cysteine desulfurase  43.56 
 
 		 404 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.037165  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  41.38 
 
 		 404 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  40.96 
 
 		 407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  41.8 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  38.98 
 
 		 395 aa  259  7e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  39.42 
 
 		 382 aa  259  7e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  40.16 
 
 		 404 aa  259  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  43.29 
 
 		 404 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000240874  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0272  cysteine desulfurase  40.81 
 
 		 388 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1656  cysteine desulfurase IscS  40.9 
 
 		 408 aa  258  8e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0819836  unclonable  0.0000556983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  43.29 
 
 		 404 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34119  precursor of desulfurase cysteine desulfurase IscS  41.02 
 
 		 400 aa  258  9e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1351  aminotransferase class V  41.85 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000567164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  43.05 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  41.11 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  39.3 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1324  cysteine desulfurase IscS  41.01 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00549463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  40.85 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  39.53 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  41.11 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  39.73 
 
 		 403 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  39.63 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  39.63 
 
 		 404 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  39.63 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  40.96 
 
 		 407 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1477  putative cysteine desulfurase  40.9 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.339117  hitchhiker  0.000732384 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  40.96 
 
 		 407 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  40.96 
 
 		 407 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  39.63 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  40.96 
 
 		 407 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  39.63 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  39.79 
 
 		 405 aa  257  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0006  cysteine desulfurase  38.9 
 
 		 384 aa  257  3e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  39.37 
 
 		 407 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  38.54 
 
 		 406 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  40.32 
 
 		 407 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  39.79 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  39.95 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  39.89 
 
 		 405 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  40.43 
 
 		 407 aa  256  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  39.36 
 
 		 404 aa  255  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1001  aminotransferase, class V  38.79 
 
 		 508 aa  255  9e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>