208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1038 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1038  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  557  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1272  hypothetical protein  93.48 
 
 
276 aa  530  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413373  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1771  hypothetical protein  81.45 
 
 
276 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.192565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1493  hypothetical protein  81.45 
 
 
290 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1493  hypothetical protein  81.09 
 
 
276 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.0229535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4299  hypothetical protein  82.25 
 
 
276 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3570  hypothetical protein  68.98 
 
 
284 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.231814  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2535  hypothetical protein  63.64 
 
 
277 aa  360  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1827  hypothetical protein  67.88 
 
 
283 aa  355  5.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.660608  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0161  hypothetical protein  60.22 
 
 
279 aa  348  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0395  hypothetical protein  62.74 
 
 
279 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.851588  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0426  hypothetical protein  60.58 
 
 
279 aa  345  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1256  hypothetical protein  61.71 
 
 
274 aa  343  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884363  normal  0.635489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0300  hypothetical protein  61.98 
 
 
279 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0294  hypothetical protein  62.36 
 
 
279 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0112  hypothetical protein  62.5 
 
 
280 aa  338  7e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0617096  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0102  hypothetical protein  61.28 
 
 
280 aa  335  7e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.700669  normal  0.0643528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3478  hypothetical protein  60.84 
 
 
272 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2974  hypothetical protein  55.81 
 
 
279 aa  314  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3209  hypothetical protein  59.55 
 
 
273 aa  311  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2832  hypothetical protein  57.46 
 
 
274 aa  311  9e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4261  hypothetical protein  56.72 
 
 
273 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3935  hypothetical protein  57.03 
 
 
273 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0001  hypothetical protein  55.02 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2067  hypothetical protein  58.21 
 
 
279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1987  hypothetical protein  58.21 
 
 
342 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0008  hypothetical protein  52.36 
 
 
279 aa  300  1e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000149739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5015  hypothetical protein  54.96 
 
 
300 aa  296  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.646815  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0117  hypothetical protein  54.37 
 
 
280 aa  295  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0853  hypothetical protein  57.03 
 
 
276 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2842  hypothetical protein  53.05 
 
 
270 aa  287  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2476  hypothetical protein  49.44 
 
 
292 aa  238  8e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000868327  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2027  protein of unknown function DUF299  46.42 
 
 
282 aa  228  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3615  hypothetical protein  45.74 
 
 
275 aa  224  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0372384  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0341  hypothetical protein  38.95 
 
 
276 aa  219  3e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0450  hypothetical protein  41.89 
 
 
269 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.410231  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0207  hypothetical protein  38.85 
 
 
273 aa  209  5e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.188984  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0895  hypothetical protein  39.62 
 
 
273 aa  207  1e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0530505  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0324  hypothetical protein  40.52 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3384  hypothetical protein  40.75 
 
 
269 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0242  hypothetical protein  38.61 
 
 
270 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000920948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0226  hypothetical protein  38.22 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4292  hypothetical protein  38.17 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000020091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2958  hypothetical protein  37.97 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000086443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0997  hypothetical protein  38.52 
 
 
269 aa  178  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4252  hypothetical protein  36.23 
 
 
273 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4244  protein of unknown function DUF299  37.69 
 
 
267 aa  175  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1123  hypothetical protein  36.29 
 
 
283 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000765739  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1731  protein of unknown function DUF299  34.75 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.835387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0606  hypothetical protein  36.68 
 
 
294 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1513  hypothetical protein  36.15 
 
 
273 aa  163  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2385  protein of unknown function DUF299  35.02 
 
 
270 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000686873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12430  hypothetical protein  34.11 
 
 
266 aa  158  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2438  hypothetical protein  33.98 
 
 
268 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3778  hypothetical protein  34.88 
 
 
278 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110006  normal  0.0388947 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1606  protein of unknown function DUF299  35.09 
 
 
288 aa  155  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1210  protein of unknown function DUF299  33.98 
 
 
278 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0432176  normal  0.0742769 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0076  hypothetical protein  34.77 
 
 
266 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2470  hypothetical protein  33.08 
 
 
286 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3205  protein of unknown function DUF299  36.6 
 
 
327 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.497466  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2169  hypothetical protein  33.59 
 
 
272 aa  151  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0487  hypothetical protein  34.46 
 
 
269 aa  151  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1386  protein of unknown function DUF299  37.69 
 
 
296 aa  151  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.219647  normal  0.606212 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1655  hypothetical protein  31.7 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.495663  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1060  protein of unknown function DUF299  33.71 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1621  hypothetical protein  31.7 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1671  hypothetical protein  31.27 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0823  hypothetical protein  35.71 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00069983  hitchhiker  3.3678e-21 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1129  hypothetical protein  32.45 
 
 
272 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.199168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4376  hypothetical protein  35.34 
 
 
270 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00178025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4196  hypothetical protein  35.34 
 
 
270 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4034  hypothetical protein  35.34 
 
 
270 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4044  hypothetical protein  35.34 
 
 
270 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4520  hypothetical protein  35.34 
 
 
270 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0596835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4318  hypothetical protein  35.34 
 
 
270 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8414e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4429  hypothetical protein  35.34 
 
 
270 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4413  hypothetical protein  35.34 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0617716  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2417  hypothetical protein  35.63 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4147  hypothetical protein  34.96 
 
 
270 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3022  hypothetical protein  35.71 
 
 
270 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3045  protein of unknown function DUF299  31.27 
 
 
277 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137602  normal  0.0560946 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1033  hypothetical protein  34.88 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0336  protein of unknown function DUF299  30.38 
 
 
276 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1350  hypothetical protein  32.7 
 
 
270 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000757872  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0347  hypothetical protein  31.44 
 
 
276 aa  135  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2367  hypothetical protein  38.41 
 
 
276 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1381  hypothetical protein  41.52 
 
 
273 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2880  hypothetical protein  38.41 
 
 
276 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0279638  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11040  hypothetical protein  31.85 
 
 
307 aa  133  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5065  hypothetical protein  36.53 
 
 
273 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2049  hypothetical protein  41.43 
 
 
273 aa  132  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00380  hypothetical protein  33.93 
 
 
291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17550  hypothetical protein  34.07 
 
 
277 aa  129  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.556349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2291  hypothetical protein  32.75 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.909521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2190  hypothetical protein  35.71 
 
 
273 aa  125  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1815  hypothetical protein  39.72 
 
 
273 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00923  hypothetical protein  35.74 
 
 
267 aa  125  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.052197  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2427  protein of unknown function DUF299  34.83 
 
 
274 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1758  hypothetical protein  35.27 
 
 
272 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.572502  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3043  hypothetical protein  38.85 
 
 
273 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>