82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1943 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  100 
 
 		 117 aa  240  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  59.48 
 
 		 116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  60.17 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  50 
 
 		 115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  50 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  48.65 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  50 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  50 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  50 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  50 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  50 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  50 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  49.09 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  49.09 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  53.15 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  48.18 
 
 		 115 aa  110  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  51.82 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  49.52 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  45.63 
 
 		 116 aa  98.2  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  45.61 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  40.34 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  42.98 
 
 		 117 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  42.98 
 
 		 117 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  33.64 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  32.43 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  36 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  28.07 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  34.82 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  32.14 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  30.84 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  32.14 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  37.08 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  38.71 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  33.33 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  38 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  36.78 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  35.96 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  38.37 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  29.66 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  29.91 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  31.43 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  28.44 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  37.21 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  33.65 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  30.09 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  32.77 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  33.65 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  30.91 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  27.43 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  26.72 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  29.06 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  36.05 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  29.63 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  35.35 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  32.97 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  32.08 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  32.38 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  37.31 
 
 		 240 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  31.03 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  28.44 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  30.19 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  46 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  31 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  36.11 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  23.6 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  30.83 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  34.92 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  26.36 
 
 		 118 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  31.34 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  34.67 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3615  ribonuclease P protein component  36.49 
 
 		 385 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  33.33 
 
 		 79 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  29.09 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  32.39 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  25.89 
 
 		 127 aa  40.8  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  29.63 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  38.24 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>