65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1800 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  775    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  51.79 
 
 		 383 aa  368  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  29.89 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  30.26 
 
 		 371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  31.71 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  28.79 
 
 		 351 aa  89.4  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  28.4 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  25.67 
 
 		 328 aa  86.3  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  31.02 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.36 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.46 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  25.48 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  26.52 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  26.27 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  26.38 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  28.51 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  26.51 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  27.64 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  26.26 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  34.04 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  25.36 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  26.38 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  25.56 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  24.4 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  24.4 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.02 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  28.51 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  27.54 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  24.72 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  21.76 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.64 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  26.29 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  24.44 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  26.29 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  26.72 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.59 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.45 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  25.53 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  25.87 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  25.87 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  24.4 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.81 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.02 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  23.6 
 
 		 489 aa  57  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.16 
 
 		 414 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  26.41 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  25 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  25 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.51 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  25.21 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.29 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  24.83 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.43 
 
 		 521 aa  50.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  30.34 
 
 		 369 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  20.88 
 
 		 353 aa  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  25.35 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  23.94 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.68 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  25 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  21.96 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  20.91 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.86 
 
 		 361 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  23.08 
 
 		 368 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  24.31 
 
 		 369 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  24.42 
 
 		 369 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>